128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0784 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  100 
 
 
1075 aa  2210    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  32.91 
 
 
1041 aa  537  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  27.43 
 
 
986 aa  324  4e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  26.67 
 
 
979 aa  288  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  26.25 
 
 
1125 aa  258  6e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  27.45 
 
 
1075 aa  250  9e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 
1167 aa  250  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 
1123 aa  242  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 
1153 aa  210  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  38.39 
 
 
1232 aa  208  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  25.49 
 
 
1122 aa  197  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  37.8 
 
 
1149 aa  194  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  38.85 
 
 
1105 aa  192  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  36.5 
 
 
1195 aa  191  8e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  27.18 
 
 
1069 aa  190  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 
1123 aa  187  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  34.12 
 
 
1141 aa  176  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  33.54 
 
 
1203 aa  175  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  33.79 
 
 
511 aa  170  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  37.21 
 
 
1298 aa  168  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 
1124 aa  165  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 
1016 aa  162  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 
1206 aa  162  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  32.09 
 
 
1194 aa  161  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  33.97 
 
 
1176 aa  160  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  32.21 
 
 
1257 aa  160  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  34.69 
 
 
1114 aa  159  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 
1026 aa  157  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  31.43 
 
 
1210 aa  157  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  25.82 
 
 
1008 aa  152  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  31.27 
 
 
1161 aa  150  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  26.48 
 
 
1012 aa  150  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 
1188 aa  149  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  34.19 
 
 
1105 aa  149  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  33.22 
 
 
1196 aa  148  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 
1065 aa  145  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  31.71 
 
 
1162 aa  142  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  30.82 
 
 
1162 aa  140  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  35.58 
 
 
992 aa  137  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  30.81 
 
 
1071 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  32.63 
 
 
1132 aa  132  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  25.35 
 
 
1097 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  21.26 
 
 
966 aa  131  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  31.33 
 
 
1173 aa  131  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  30.87 
 
 
1052 aa  128  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  32.22 
 
 
1010 aa  125  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  25.39 
 
 
1077 aa  125  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  26.17 
 
 
1116 aa  124  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  24.07 
 
 
1068 aa  122  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  28.93 
 
 
1067 aa  117  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  28.71 
 
 
1053 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  29.62 
 
 
1068 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 
1010 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 
1008 aa  116  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  26.7 
 
 
1066 aa  115  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  23.98 
 
 
1061 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  23.69 
 
 
1074 aa  111  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  24.96 
 
 
1056 aa  110  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  27.62 
 
 
1125 aa  108  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  26.96 
 
 
1194 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  23.33 
 
 
1007 aa  103  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 
991 aa  103  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  23.97 
 
 
1007 aa  103  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  23.68 
 
 
1100 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  21.53 
 
 
1105 aa  100  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  22.86 
 
 
1129 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  21.89 
 
 
1074 aa  99.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  22.44 
 
 
972 aa  99  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  22.17 
 
 
1037 aa  95.9  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  22.66 
 
 
1081 aa  95.5  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  26.01 
 
 
1122 aa  92.8  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  26.01 
 
 
1120 aa  92.4  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  26.4 
 
 
1126 aa  91.3  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  26.23 
 
 
994 aa  90.9  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 
1066 aa  90.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  21.38 
 
 
1041 aa  89.7  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  27.33 
 
 
1109 aa  89  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  22.1 
 
 
1071 aa  87.8  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  23.45 
 
 
1008 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  23 
 
 
1050 aa  87  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  27.3 
 
 
997 aa  85.1  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  26.47 
 
 
1066 aa  85.1  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 
993 aa  85.1  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  26.77 
 
 
1001 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  22.25 
 
 
1051 aa  82.4  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  22.75 
 
 
1057 aa  79.3  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 
1066 aa  77.8  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  24.48 
 
 
1054 aa  75.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 
888 aa  74.3  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 
1007 aa  73.9  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 
952 aa  73.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 
1089 aa  69.3  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 
897 aa  68.9  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  25.55 
 
 
1008 aa  68.2  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2574  hypothetical protein  24.51 
 
 
710 aa  66.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 
1087 aa  64.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  28.5 
 
 
799 aa  63.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 
943 aa  63.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 
871 aa  63.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  27.46 
 
 
782 aa  63.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>