134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0783 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1041 aa  2148    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  32.88 
 
 		 1075 aa  533  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  28.91 
 
 		 986 aa  376  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  26.99 
 
 		 979 aa  322  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 1149 aa  251  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  26.41 
 
 		 1125 aa  251  7e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1075 aa  230  8e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 1167 aa  219  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  26.73 
 
 		 1069 aa  219  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 1123 aa  211  8e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 1232 aa  197  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1132 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1141 aa  192  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  29.03 
 
 		 992 aa  191  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 1105 aa  187  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  34.48 
 
 		 1195 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  34.57 
 
 		 1123 aa  179  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  36.14 
 
 		 1105 aa  179  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 1065 aa  177  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  35.53 
 
 		 1176 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1122 aa  171  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 1153 aa  170  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  33.44 
 
 		 1257 aa  169  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  35.69 
 
 		 1298 aa  168  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  26.07 
 
 		 1012 aa  164  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1074 aa  164  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  36.16 
 
 		 1162 aa  162  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 1007 aa  159  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  31.15 
 
 		 1194 aa  158  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1008 aa  155  5e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  32.32 
 
 		 1203 aa  152  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  31.83 
 
 		 1161 aa  148  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  32.01 
 
 		 511 aa  147  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 1016 aa  147  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 1008 aa  147  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 1188 aa  145  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  25.49 
 
 		 1010 aa  145  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  24.56 
 
 		 1125 aa  145  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  32.96 
 
 		 1196 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  24.03 
 
 		 1068 aa  144  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  26.36 
 
 		 1081 aa  142  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  25.72 
 
 		 1097 aa  141  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  33.23 
 
 		 1114 aa  138  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1052 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 1026 aa  135  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  24.15 
 
 		 1007 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  30.75 
 
 		 1210 aa  132  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1077 aa  132  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  24.61 
 
 		 966 aa  128  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 993 aa  128  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1068 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1162 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  25.15 
 
 		 1041 aa  125  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1071 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  33.75 
 
 		 1173 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 991 aa  120  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  25.37 
 
 		 1066 aa  119  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  22.95 
 
 		 972 aa  118  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  22.72 
 
 		 1067 aa  118  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  25 
 
 		 1057 aa  118  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  21.77 
 
 		 1010 aa  117  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 1206 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 1007 aa  117  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 1124 aa  115  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  24.5 
 
 		 1001 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  24.96 
 
 		 1037 aa  112  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1071 aa  112  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1105 aa  112  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  29.04 
 
 		 1053 aa  111  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1109 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  27.64 
 
 		 1061 aa  108  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  22.44 
 
 		 1074 aa  107  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  31.89 
 
 		 1120 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  31.89 
 
 		 1122 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  23.48 
 
 		 1100 aa  107  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1066 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1126 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  30.87 
 
 		 1066 aa  103  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  22.22 
 
 		 994 aa  101  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  22.39 
 
 		 1051 aa  101  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  29.02 
 
 		 1194 aa  100  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  25.92 
 
 		 1056 aa  99  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  27 
 
 		 1008 aa  98.6  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  22.85 
 
 		 1050 aa  98.2  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  27.6 
 
 		 1116 aa  98.2  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 1066 aa  95.1  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  22.51 
 
 		 1129 aa  94.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  22.22 
 
 		 997 aa  92  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 1054 aa  87.4  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1008 aa  72.8  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 1089 aa  69.3  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 1087 aa  68.9  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 833 aa  65.1  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 952 aa  63.9  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 897 aa  63.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 888 aa  62.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  21.86 
 
 		 749 aa  59.3  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 866 aa  59.3  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  29.07 
 
 		 800 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2028  TonB family protein  23.81 
 
 		 960 aa  57  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.38309 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>