More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0779 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  100 
 
 		 608 aa  1251    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  41.01 
 
 		 896 aa  422  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  41.24 
 
 		 902 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3003  ATP-dependent DNA ligase  40.34 
 
 		 882 aa  398  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0636525  normal  0.554248 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4309  DNA polymerase LigD ligase subunit  40.54 
 
 		 603 aa  389  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  41.45 
 
 		 861 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1858  DNA ligase D  41 
 
 		 940 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.216644 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0981  DNA ligase D  40.74 
 
 		 954 aa  389  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2523  ATP-dependent DNA ligase  39.43 
 
 		 837 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000543878 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2239  DNA ligase D  40.89 
 
 		 856 aa  382  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.839838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3464  DNA ligase, ATP-dependent, putative  40.27 
 
 		 851 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2247  ATP-dependent DNA ligase  40.1 
 
 		 846 aa  378  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3452  ATP dependent DNA ligase  39.01 
 
 		 534 aa  379  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  39.02 
 
 		 867 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0501  DNA ligase D  38.54 
 
 		 863 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535245  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5079  ATP-dependent DNA ligase  39.83 
 
 		 901 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.795218  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1177  ATP-dependent DNA ligase  38.01 
 
 		 853 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  40.92 
 
 		 871 aa  365  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  38.74 
 
 		 845 aa  365  1e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  40.13 
 
 		 872 aa  363  4e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2097  ATP-dependent DNA ligase  37.5 
 
 		 848 aa  361  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1660  ATP-dependent DNA ligase  38.85 
 
 		 847 aa  360  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.600549  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2635  ATP-dependent DNA ligase  38.54 
 
 		 833 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232561  normal  0.576376 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2328  putative ATP-dependent DNA ligase  38.39 
 
 		 1001 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455665  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3260  ATP-dependent DNA ligase  37.85 
 
 		 833 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2501  ATP-dependent DNA ligase  37.11 
 
 		 833 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4315  DNA ligase D  39.03 
 
 		 834 aa  351  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1150  ATP dependent DNA ligase  40.54 
 
 		 845 aa  349  8e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5476  DNA ligase D  38.46 
 
 		 927 aa  349  9e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388357 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  38.36 
 
 		 847 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2651  ATP-dependent DNA ligase  36.77 
 
 		 832 aa  346  8e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.819142  normal  0.570676 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  36.18 
 
 		 865 aa  345  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5610  ATP dependent DNA ligase  37.95 
 
 		 932 aa  343  5e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5705  ATP-dependent DNA ligase  37.72 
 
 		 883 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6340  DNA ligase D  37.74 
 
 		 949 aa  340  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.15116 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5341  ATP-dependent DNA ligase  37.32 
 
 		 881 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0581605 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5638  ATP-dependent DNA ligase  37.46 
 
 		 882 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6483  ATP dependent DNA ligase  37.13 
 
 		 936 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1346  ATP dependent DNA ligase  37.33 
 
 		 936 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.893044  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  37.54 
 
 		 877 aa  336  7e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6329  ATP-dependent DNA ligase  37.77 
 
 		 895 aa  336  9e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632091 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3490  ATP-dependent DNA ligase  36.95 
 
 		 930 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3907  ATP-dependent DNA ligase  38.1 
 
 		 900 aa  332  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.989644  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0353  ATP-dependent DNA ligase  38.52 
 
 		 913 aa  331  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.344654 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1695  ATP dependent DNA ligase  38.14 
 
 		 843 aa  332  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616199  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6073  DNA ligase D  37.29 
 
 		 927 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4339  ATP-dependent DNA ligase  36.77 
 
 		 871 aa  328  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3245  ATP-dependent DNA ligase  37.25 
 
 		 866 aa  327  6e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.833216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  35.66 
 
 		 864 aa  326  7e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8017  ATP-dependent DNA ligase  36.62 
 
 		 893 aa  322  9.000000000000001e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4365  ATP-dependent DNA ligase  37.85 
 
 		 886 aa  322  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3685  ATP-dependent DNA ligase  36.84 
 
 		 911 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  37.86 
 
 		 825 aa  318  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1769  ATP-dependent DNA ligase  36.63 
 
 		 918 aa  316  6e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3982  DNA ligase D  37.52 
 
 		 837 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.242041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4171  ATP-dependent DNA ligase  37.98 
 
 		 914 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497319  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1736  ATP-dependent DNA ligase  36.71 
 
 		 888 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.946456 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1876  ATP-dependent DNA ligase  37.06 
 
 		 914 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.907588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0448  ATP-dependent DNA ligase  38.27 
 
 		 866 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4303  DNA ligase D  35.75 
 
 		 817 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2988  DNA ligase, ATP-dependent  34.04 
 
 		 1163 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2679  ATP-dependent DNA ligase  35.5 
 
 		 868 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3112  DNA ligase D  36.4 
 
 		 1157 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0919454  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  32.01 
 
 		 831 aa  251  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7782  putative ATP-dependent DNA ligase  43.38 
 
 		 351 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  36.68 
 
 		 855 aa  228  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0382  DNA ligase D  39.26 
 
 		 644 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  38.82 
 
 		 646 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  39.22 
 
 		 495 aa  216  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2233  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  29.81 
 
 		 858 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  39.12 
 
 		 656 aa  210  6e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0832  DNA ligase D  38.69 
 
 		 684 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0784  ATP dependent DNA ligase  39.81 
 
 		 658 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2002  ATP dependent DNA ligase  38.87 
 
 		 316 aa  206  9e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3173  ATP-dependent DNA ligase  39.08 
 
 		 847 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36910  ATP-dependent DNA ligase  39.38 
 
 		 840 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0564843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7647  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  52.22 
 
 		 544 aa  204  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2135  DNA ligase D  36.1 
 
 		 815 aa  201  3e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6876  ATP dependent DNA ligase  35.76 
 
 		 343 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747253  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6253  DNA polymerase LigD ligase subunit  36.28 
 
 		 343 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0234052  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3217  ATP-dependent DNA ligase  58.86 
 
 		 837 aa  196  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.311781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  37.74 
 
 		 321 aa  195  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0836  DNA ligase D  39.81 
 
 		 683 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3242  DNA ligase D  36.68 
 
 		 657 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.99209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34920  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  39.51 
 
 		 477 aa  194  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140848  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7010  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  35.93 
 
 		 350 aa  193  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  35.82 
 
 		 828 aa  192  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4424  ATP-dependent DNA ligase  56.47 
 
 		 825 aa  191  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0379748  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1488  ATP dependent DNA ligase, central  38.36 
 
 		 320 aa  191  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  38.6 
 
 		 763 aa  191  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  38.2 
 
 		 766 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6989  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  35.01 
 
 		 354 aa  188  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0935  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  53.19 
 
 		 789 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0727399  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  36.08 
 
 		 896 aa  187  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  37.62 
 
 		 758 aa  187  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  37.62 
 
 		 758 aa  187  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0932  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  53.19 
 
 		 737 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.819515  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  50.25 
 
 		 822 aa  186  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  37.69 
 
 		 758 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2225  DNA ligase  57.49 
 
 		 213 aa  184  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>