More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0704 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  100 
 
 
383 aa  783    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  63.32 
 
 
437 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  62.5 
 
 
427 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  61.96 
 
 
427 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  61.96 
 
 
427 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  60.11 
 
 
388 aa  454  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  59.84 
 
 
386 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  58.47 
 
 
383 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  59.29 
 
 
387 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  57.69 
 
 
387 aa  441  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  57.71 
 
 
383 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  58.81 
 
 
388 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  59.94 
 
 
383 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  51.87 
 
 
372 aa  380  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  51.98 
 
 
397 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  54.42 
 
 
356 aa  358  7e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  52.3 
 
 
360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  49.86 
 
 
375 aa  355  5.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  53.69 
 
 
362 aa  354  1e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  51.3 
 
 
382 aa  351  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  51.15 
 
 
365 aa  351  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  52.12 
 
 
358 aa  351  1e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  47.93 
 
 
366 aa  350  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  51.26 
 
 
375 aa  350  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  47.93 
 
 
366 aa  350  3e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  50.86 
 
 
366 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  50.86 
 
 
366 aa  349  6e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  50.57 
 
 
366 aa  348  6e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  50.72 
 
 
351 aa  348  8e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  50.29 
 
 
365 aa  348  9e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  49.71 
 
 
365 aa  347  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1808  twitching motility protein  51.86 
 
 
432 aa  346  4e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.96744  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  50.84 
 
 
366 aa  346  4e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  50 
 
 
368 aa  346  5e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  50.55 
 
 
378 aa  345  8.999999999999999e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1130  twitching motility protein  52.12 
 
 
366 aa  344  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  51.69 
 
 
566 aa  345  1e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  49.28 
 
 
365 aa  343  4e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09510  pilus retraction protein PilT  51 
 
 
362 aa  342  5e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477048  normal  0.984681 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  49.72 
 
 
366 aa  342  5.999999999999999e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  48.75 
 
 
366 aa  342  5.999999999999999e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  50 
 
 
349 aa  341  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  51.44 
 
 
430 aa  340  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  52.45 
 
 
367 aa  338  7e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  50.14 
 
 
374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  52.16 
 
 
362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  48.85 
 
 
363 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  50.86 
 
 
347 aa  336  5e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  47.69 
 
 
360 aa  335  1e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  49.86 
 
 
362 aa  335  1e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  50.42 
 
 
360 aa  334  1e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  49.71 
 
 
368 aa  334  1e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  47.98 
 
 
363 aa  334  2e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1214  twitching motility protein  51.44 
 
 
396 aa  333  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  50.58 
 
 
370 aa  333  4e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1661  twitching mobility protein  49.3 
 
 
402 aa  332  5e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.423515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  47.88 
 
 
374 aa  332  9e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0335  twitching motility protein PilT  48.39 
 
 
398 aa  330  2e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  47.41 
 
 
351 aa  329  4e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  48.27 
 
 
349 aa  329  6e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  49.43 
 
 
344 aa  328  8e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  47.31 
 
 
362 aa  328  9e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  49.71 
 
 
344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  45.78 
 
 
372 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  50.14 
 
 
344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  46.59 
 
 
358 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  49.43 
 
 
344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2666  twitching motility protein  49.58 
 
 
368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  48.26 
 
 
345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  47.71 
 
 
347 aa  325  6e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  48.85 
 
 
347 aa  325  6e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  50.14 
 
 
372 aa  325  9e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  46.46 
 
 
360 aa  325  9e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  47.66 
 
 
365 aa  323  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  50.57 
 
 
359 aa  323  2e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  50.89 
 
 
348 aa  323  3e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  47.7 
 
 
344 aa  323  3e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  49.86 
 
 
360 aa  323  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  48.26 
 
 
349 aa  323  3e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  52.02 
 
 
403 aa  323  3e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  50 
 
 
350 aa  323  4e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  49.7 
 
 
350 aa  323  4e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  47.7 
 
 
344 aa  322  5e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  48.56 
 
 
344 aa  322  7e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  44.96 
 
 
374 aa  322  8e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  47.97 
 
 
345 aa  322  8e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  47.97 
 
 
345 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  47.97 
 
 
345 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  47.75 
 
 
356 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  49.71 
 
 
351 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  47.97 
 
 
345 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  48.56 
 
 
350 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  52.08 
 
 
352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  47.11 
 
 
345 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  47.97 
 
 
345 aa  319  5e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  47.38 
 
 
345 aa  319  5e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  47.38 
 
 
345 aa  319  5e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  47.38 
 
 
345 aa  319  5e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  46.84 
 
 
347 aa  319  6e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  51.35 
 
 
339 aa  319  6e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>