131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0638 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  100 
 
 
1069 aa  2192  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  4.6909e-05  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 
1105 aa  357  6e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  28.63 
 
 
1125 aa  342  3e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 
1065 aa  335  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 
1176 aa  319  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 
1153 aa  316  1e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  6.52763e-05  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 
1123 aa  313  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 
1123 aa  310  8e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  28.01 
 
 
1075 aa  308  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  26.64 
 
 
1196 aa  307  9e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  27.48 
 
 
1132 aa  300  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 
1124 aa  292  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 
1149 aa  290  9e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  27.63 
 
 
1195 aa  288  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 
1167 aa  284  6e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  27.57 
 
 
1173 aa  281  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  26.81 
 
 
1161 aa  277  8e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 
1232 aa  268  3e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  27.75 
 
 
1122 aa  259  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  27.22 
 
 
1141 aa  257  1e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  26.02 
 
 
1162 aa  246  2e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 
1206 aa  241  6e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 
1041 aa  221  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  25.67 
 
 
986 aa  217  9e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  25.29 
 
 
1162 aa  215  4e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  24.69 
 
 
1210 aa  212  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  25.97 
 
 
1194 aa  207  7e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  26.89 
 
 
1075 aa  195  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  25 
 
 
1194 aa  191  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  24.98 
 
 
1105 aa  187  1e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  27.39 
 
 
1257 aa  179  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 
1114 aa  177  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  33.54 
 
 
511 aa  159  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  35.49 
 
 
1203 aa  158  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  27.72 
 
 
1298 aa  150  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  23.52 
 
 
979 aa  149  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  25.58 
 
 
992 aa  145  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 
1097 aa  144  1e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  25.4 
 
 
1068 aa  142  4e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  23.89 
 
 
1052 aa  138  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  31.58 
 
 
1067 aa  135  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
1188 aa  129  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  23.73 
 
 
1068 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  25.35 
 
 
1077 aa  125  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  23.74 
 
 
966 aa  125  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  24.44 
 
 
1100 aa  124  1e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  29.8 
 
 
1071 aa  122  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  25.03 
 
 
1081 aa  117  1e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  24.39 
 
 
1056 aa  116  2e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  25.14 
 
 
1074 aa  115  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  23.22 
 
 
1129 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  29.6 
 
 
1122 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  30.38 
 
 
1126 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  30.31 
 
 
1120 aa  110  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  29.69 
 
 
1008 aa  108  7e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  25.83 
 
 
1066 aa  108  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 
1074 aa  107  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  23.98 
 
 
1054 aa  106  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  30.84 
 
 
1125 aa  106  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  24.56 
 
 
1041 aa  106  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 
1008 aa  105  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  22.46 
 
 
1105 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2574  hypothetical protein  24.63 
 
 
710 aa  104  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  26.58 
 
 
1053 aa  102  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 
1066 aa  95.1  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 
1016 aa  94.7  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  23.49 
 
 
1066 aa  94.4  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  28.17 
 
 
1010 aa  93.6  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  27.99 
 
 
1109 aa  93.6  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  22.66 
 
 
1071 aa  92.8  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 
991 aa  90.1  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  25.85 
 
 
1051 aa  89.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 
1026 aa  88.6  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 
1010 aa  88.2  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 
1007 aa  87.8  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  29.37 
 
 
972 aa  86.3  3e-15  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 
993 aa  84.3  1e-14  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  26.46 
 
 
1061 aa  83.2  2e-14  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  21.79 
 
 
1012 aa  82  5e-14  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  24.18 
 
 
1116 aa  80.9  1e-13  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 
1066 aa  80.1  2e-13  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  23.73 
 
 
1057 aa  78.6  6e-13  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 
888 aa  76.6  2e-12  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  26.57 
 
 
1037 aa  76.3  3e-12  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  25.24 
 
 
994 aa  75.1  6e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  25.57 
 
 
1001 aa  75.1  7e-12  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  25.8 
 
 
1008 aa  73.9  2e-11  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.45 
 
 
1050 aa  71.2  1e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  23.17 
 
 
1007 aa  69.3  3e-10  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  24.44 
 
 
997 aa  67.4  1e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 
1087 aa  66.2  3e-09  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 
1007 aa  65.1  6e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 
866 aa  65.1  7e-09  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  30.77 
 
 
799 aa  63.5  2e-08  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  24.78 
 
 
1008 aa  63.9  2e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 
833 aa  60.5  2e-07  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 
749 aa  60.5  2e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  22.61 
 
 
897 aa  58.9  5e-07  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 
1066 aa  57.8  1e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  3.68549e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 
871 aa  57.8  1e-06  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>