More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0636 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  100 
 
 
398 aa  821    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  43.31 
 
 
382 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  42.86 
 
 
380 aa  331  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  42.56 
 
 
382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  42.6 
 
 
388 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  41.62 
 
 
381 aa  301  9e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  39.11 
 
 
381 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  42.22 
 
 
380 aa  299  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  38.85 
 
 
385 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  39.06 
 
 
381 aa  293  3e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  41.05 
 
 
381 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  37.7 
 
 
386 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  37.43 
 
 
386 aa  287  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  41.21 
 
 
379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  39.31 
 
 
380 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  40.58 
 
 
400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  39.79 
 
 
380 aa  278  9e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  39.47 
 
 
380 aa  278  9e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  38.42 
 
 
378 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  41.51 
 
 
379 aa  276  5e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  39.63 
 
 
383 aa  276  6e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  39.27 
 
 
384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  37.7 
 
 
381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  38.38 
 
 
381 aa  267  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  38.38 
 
 
392 aa  267  2e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  40.17 
 
 
413 aa  266  5.999999999999999e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  36.65 
 
 
380 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  41.62 
 
 
383 aa  259  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  40.11 
 
 
380 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  38.02 
 
 
385 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  38.27 
 
 
385 aa  255  8e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  38.78 
 
 
388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  37.53 
 
 
383 aa  251  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  36.27 
 
 
390 aa  250  3e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  38.62 
 
 
387 aa  247  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  36.75 
 
 
381 aa  247  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  36.65 
 
 
376 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  38.46 
 
 
386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  36.18 
 
 
382 aa  239  5e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  35.88 
 
 
388 aa  238  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  35.92 
 
 
383 aa  225  9e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  32.72 
 
 
378 aa  223  4e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  31.69 
 
 
380 aa  218  1e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  33.85 
 
 
392 aa  203  6e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.74 
 
 
406 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.48 
 
 
406 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.47 
 
 
406 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.73 
 
 
406 aa  192  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  31.47 
 
 
406 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  31.47 
 
 
406 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  31.47 
 
 
406 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  31.47 
 
 
406 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  31.47 
 
 
406 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  31.73 
 
 
406 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  31.73 
 
 
406 aa  190  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  31.73 
 
 
406 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  31.73 
 
 
406 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  33.51 
 
 
896 aa  189  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  32.47 
 
 
393 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  32.48 
 
 
879 aa  188  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  31.78 
 
 
393 aa  187  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.17 
 
 
412 aa  186  8e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  30.49 
 
 
394 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  31.96 
 
 
410 aa  181  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  33.33 
 
 
878 aa  182  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.61 
 
 
406 aa  181  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.54 
 
 
417 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.32 
 
 
410 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.82 
 
 
414 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  29.52 
 
 
408 aa  179  7e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  32.13 
 
 
393 aa  178  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2187  aminotransferase class V  33.59 
 
 
422 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  30.73 
 
 
421 aa  176  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.53 
 
 
433 aa  176  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  32.35 
 
 
408 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  29.66 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  30.03 
 
 
405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.08 
 
 
429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.28 
 
 
412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  29.97 
 
 
430 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.33 
 
 
429 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.08 
 
 
429 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  30.93 
 
 
395 aa  173  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  29.49 
 
 
394 aa  173  5e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.56 
 
 
415 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.51 
 
 
885 aa  171  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.26 
 
 
409 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.81 
 
 
418 aa  169  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.31 
 
 
414 aa  169  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  31.43 
 
 
880 aa  169  8e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.61 
 
 
418 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  29.08 
 
 
410 aa  167  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.37 
 
 
572 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  31.04 
 
 
414 aa  168  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.96 
 
 
416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.97 
 
 
425 aa  167  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  32.06 
 
 
414 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  30.71 
 
 
416 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1235  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.78 
 
 
443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30 
 
 
435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>