More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0596 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  100 
 
 
572 aa  1147    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  41.39 
 
 
574 aa  392  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  40.46 
 
 
554 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  40.53 
 
 
558 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  38.42 
 
 
567 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  40.81 
 
 
554 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  38.42 
 
 
570 aa  381  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  37.09 
 
 
579 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  36.92 
 
 
583 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  36.92 
 
 
583 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  37.21 
 
 
566 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  36.92 
 
 
579 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  37.28 
 
 
577 aa  371  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  36.81 
 
 
579 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  36.63 
 
 
579 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  39.29 
 
 
565 aa  371  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  36.74 
 
 
579 aa  369  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  36.92 
 
 
579 aa  369  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  36.74 
 
 
579 aa  369  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  40.03 
 
 
578 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  36.92 
 
 
579 aa  365  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  39.79 
 
 
572 aa  363  4e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  39.96 
 
 
553 aa  361  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  40.6 
 
 
553 aa  360  5e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  35.53 
 
 
579 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  38.68 
 
 
556 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  36.8 
 
 
557 aa  357  3.9999999999999996e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  35.11 
 
 
573 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  38.47 
 
 
569 aa  350  5e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  39.89 
 
 
553 aa  350  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  38.48 
 
 
560 aa  349  7e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  36.32 
 
 
573 aa  348  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  36.16 
 
 
562 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  37.95 
 
 
574 aa  342  1e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  36.46 
 
 
555 aa  340  4e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  37.95 
 
 
568 aa  340  4e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  37.46 
 
 
605 aa  340  5e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  36.35 
 
 
554 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  37.3 
 
 
556 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  36.8 
 
 
565 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  36.03 
 
 
562 aa  335  1e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  39.33 
 
 
558 aa  333  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  34.1 
 
 
556 aa  333  7.000000000000001e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  36.75 
 
 
554 aa  332  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  34.74 
 
 
558 aa  331  2e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  34.95 
 
 
588 aa  330  6e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  36.4 
 
 
560 aa  329  8e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  34.43 
 
 
588 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  33.97 
 
 
588 aa  327  3e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  32.28 
 
 
574 aa  327  3e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  36.64 
 
 
561 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0769  DNA repair protein RecN  39.93 
 
 
606 aa  326  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1860  DNA repair protein RecN  38.14 
 
 
558 aa  325  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.457848  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0776  DNA repair protein RecN  38.42 
 
 
611 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163902  normal  0.739738 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  35.04 
 
 
559 aa  325  1e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  35.41 
 
 
555 aa  325  1e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0769  DNA repair protein RecN  39.93 
 
 
606 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  35.46 
 
 
554 aa  323  4e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  35.82 
 
 
554 aa  323  4e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0732  DNA repair protein RecN  39.62 
 
 
606 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.813778  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  35.35 
 
 
552 aa  323  6e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  35.35 
 
 
552 aa  323  6e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  34.39 
 
 
559 aa  322  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  34.39 
 
 
559 aa  322  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  35.17 
 
 
552 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  33.45 
 
 
555 aa  321  1.9999999999999998e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  34.64 
 
 
552 aa  321  3e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  33.21 
 
 
552 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  38.23 
 
 
561 aa  320  5e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  34.46 
 
 
552 aa  320  5e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  32.33 
 
 
565 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  37.57 
 
 
564 aa  318  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  32.33 
 
 
565 aa  318  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  34.52 
 
 
553 aa  318  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  34.64 
 
 
552 aa  316  7e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  34.64 
 
 
552 aa  316  7e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  34.64 
 
 
552 aa  316  7e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  35.31 
 
 
567 aa  316  7e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  34.64 
 
 
552 aa  316  7e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  33.87 
 
 
551 aa  316  9e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  34.74 
 
 
580 aa  316  9e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  33.33 
 
 
553 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  35.75 
 
 
567 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  34.4 
 
 
554 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  35.73 
 
 
601 aa  312  7.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  32.86 
 
 
552 aa  310  4e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  35.61 
 
 
581 aa  310  5.9999999999999995e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  32.98 
 
 
565 aa  309  1.0000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  35.89 
 
 
559 aa  307  3e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  34.16 
 
 
552 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  35.92 
 
 
587 aa  306  6e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  37.3 
 
 
557 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  33.51 
 
 
553 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  36.14 
 
 
586 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  36.91 
 
 
549 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0623  DNA repair protein RecN  35.75 
 
 
568 aa  303  7.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.72171  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  36.73 
 
 
549 aa  302  9e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  35.4 
 
 
555 aa  301  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  35.58 
 
 
560 aa  301  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  33.33 
 
 
553 aa  301  3e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>