More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0595 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
235 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.62 
 
 
224 aa  184  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  44.29 
 
 
225 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.16 
 
 
223 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.44 
 
 
224 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.52 
 
 
247 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.16 
 
 
223 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  43.64 
 
 
227 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  42.52 
 
 
257 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  42.52 
 
 
257 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  44.44 
 
 
223 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  43.32 
 
 
224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  43.32 
 
 
224 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  41.31 
 
 
245 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  37.33 
 
 
232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.09 
 
 
230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  36.07 
 
 
224 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  36.07 
 
 
224 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  39.27 
 
 
225 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.07 
 
 
268 aa  149  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0841  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.78 
 
 
311 aa  148  5e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  38.36 
 
 
225 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.36 
 
 
225 aa  148  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  38.36 
 
 
225 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.36 
 
 
225 aa  148  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  38.36 
 
 
225 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  38.36 
 
 
225 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.31 
 
 
236 aa  148  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.39 
 
 
235 aa  148  8e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  38.36 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  40.64 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  40.64 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0792  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.55 
 
 
227 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  39.17 
 
 
225 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2678  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.09 
 
 
227 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.03 
 
 
225 aa  142  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  39.09 
 
 
230 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  38.64 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  37.84 
 
 
228 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  41.95 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.53 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2364  protein TolQ  36.11 
 
 
231 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.501441 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2584  protein TolQ  38.81 
 
 
225 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.97 
 
 
224 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3892  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.81 
 
 
246 aa  138  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0697  protein TolQ  38.81 
 
 
225 aa  138  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.772794  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0680  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.81 
 
 
242 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646362  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  37.44 
 
 
222 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0772  protein TolQ  38.53 
 
 
225 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265235  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0803  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.53 
 
 
225 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.96 
 
 
229 aa  136  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.04 
 
 
232 aa  137  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0320  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.53 
 
 
225 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.35 
 
 
308 aa  136  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2213  Tol-Pal system TolQ  41.81 
 
 
240 aa  135  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000350133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.64 
 
 
231 aa  135  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3629  tolQ protein  36.97 
 
 
228 aa  135  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  35.98 
 
 
237 aa  135  7.000000000000001e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  35.98 
 
 
237 aa  135  7.000000000000001e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0732  TOLQ-like transport transmembrane protein  38.18 
 
 
230 aa  135  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0862  protein TolQ  36.57 
 
 
231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000829474  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.62 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3581  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.74 
 
 
299 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  36.84 
 
 
241 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0762  protein TolQ  41.27 
 
 
225 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167492  normal  0.258035 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3137  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.02 
 
 
247 aa  132  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3917  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  41.27 
 
 
225 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22506  normal  0.159351 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.49 
 
 
229 aa  133  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  33.77 
 
 
225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  33.77 
 
 
228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  33.77 
 
 
228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2452  protein TolQ  40.1 
 
 
225 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.48 
 
 
243 aa  132  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  35.12 
 
 
228 aa  131  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0533  protein TolQ  38.86 
 
 
225 aa  131  7.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.331397  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.02 
 
 
229 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.78 
 
 
225 aa  131  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.74 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  35 
 
 
228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  35 
 
 
228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  34.68 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  37.79 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.56 
 
 
246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  34.7 
 
 
227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.8 
 
 
228 aa  128  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.8 
 
 
228 aa  128  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.8 
 
 
228 aa  128  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  34.68 
 
 
228 aa  128  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  34.72 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  34.72 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  34.72 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  35.59 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  34.72 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  34.26 
 
 
228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  35.85 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.11 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2918  colicin uptake protein TolQ  34.98 
 
 
227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000415186  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  35.62 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  35.32 
 
 
236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  35.07 
 
 
226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>