More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0549 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 
638 aa  1324    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  36.93 
 
 
617 aa  289  8e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  30.88 
 
 
733 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2556  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  39.79 
 
 
499 aa  273  8.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000626959  hitchhiker  0.0000000459399 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1010  Slt family transglycosylase  38.36 
 
 
506 aa  270  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4010  lytic transglycosylase, catalytic  39.3 
 
 
507 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000241761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0695  Lytic transglycosylase catalytic  40.05 
 
 
499 aa  267  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000410524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0393  lytic transglycosylase, catalytic  38.17 
 
 
498 aa  267  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00582053  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0489  Lytic transglycosylase catalytic  38.94 
 
 
487 aa  263  8e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000573639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0472  lytic transglycosylase catalytic protein  39.53 
 
 
484 aa  258  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2744  Lytic transglycosylase catalytic  35.01 
 
 
448 aa  239  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.42143e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  36.54 
 
 
544 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  30.6 
 
 
544 aa  236  8e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 
587 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  28.75 
 
 
498 aa  222  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.52 
 
 
543 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  29.45 
 
 
620 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  32.76 
 
 
547 aa  218  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  29.23 
 
 
595 aa  216  9e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3789  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  34.43 
 
 
572 aa  216  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  30.72 
 
 
523 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3846  Lytic transglycosylase catalytic  34.6 
 
 
573 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  31.01 
 
 
495 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 
650 aa  210  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3932  Lytic transglycosylase catalytic  34.09 
 
 
573 aa  210  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  31.39 
 
 
534 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  29.08 
 
 
618 aa  209  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.15 
 
 
530 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  28.81 
 
 
548 aa  206  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  29.79 
 
 
596 aa  206  8e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  31.03 
 
 
554 aa  206  9e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  30.53 
 
 
539 aa  206  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  29.72 
 
 
552 aa  204  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  32.14 
 
 
580 aa  201  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  28.8 
 
 
556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  30.57 
 
 
498 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  30.51 
 
 
553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  33.19 
 
 
523 aa  199  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  33.47 
 
 
550 aa  199  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1522  Lytic transglycosylase catalytic  29.54 
 
 
561 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00867161  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30.14 
 
 
515 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  29.65 
 
 
570 aa  194  5e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  30.4 
 
 
518 aa  194  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  31.22 
 
 
515 aa  193  7e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  31 
 
 
515 aa  192  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1123  hypothetical protein  32.63 
 
 
442 aa  192  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  29.61 
 
 
534 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  30.84 
 
 
514 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  30.56 
 
 
522 aa  191  5e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1127  hypothetical protein  32.36 
 
 
442 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  28.74 
 
 
511 aa  189  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  30.54 
 
 
515 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  30.32 
 
 
515 aa  187  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  29.54 
 
 
546 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  30.5 
 
 
479 aa  185  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1895  Lytic transglycosylase catalytic  30.3 
 
 
693 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  30.09 
 
 
515 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  28.57 
 
 
519 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  30.09 
 
 
515 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0976  lytic transglycosylase, catalytic  28.35 
 
 
610 aa  184  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.773866  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  30.09 
 
 
515 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  30.09 
 
 
519 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  31.3 
 
 
447 aa  183  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  29.37 
 
 
517 aa  182  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  29.59 
 
 
479 aa  182  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  29.7 
 
 
499 aa  180  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  28.57 
 
 
524 aa  180  8e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0305  Lytic transglycosylase catalytic  30.32 
 
 
440 aa  179  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  29.7 
 
 
487 aa  179  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  27.16 
 
 
661 aa  178  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  28.45 
 
 
518 aa  177  7e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1666  peptidoglycan-binding protein LysM  28.47 
 
 
501 aa  176  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1043  lytic transglycosylase, catalytic  37.3 
 
 
281 aa  176  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0755702  hitchhiker  0.000682757 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  31.88 
 
 
442 aa  175  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  28.15 
 
 
519 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.73 
 
 
517 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.72 
 
 
532 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1379  peptidoglycan-binding LysM  27.63 
 
 
556 aa  173  6.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  27.57 
 
 
517 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3470  MltD domain-containing protein  32.98 
 
 
473 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.898295  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1857  lytic transglycosylase, catalytic  29.77 
 
 
485 aa  172  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  29.98 
 
 
495 aa  172  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  32.7 
 
 
476 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  32.43 
 
 
476 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  32.43 
 
 
476 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1987  Dyp-type peroxidase  29.83 
 
 
403 aa  169  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4430  lytic transglycosylase like protein  30.3 
 
 
524 aa  169  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408016  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3834  Lytic transglycosylase catalytic  29.55 
 
 
405 aa  167  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2870  Lytic transglycosylase catalytic  29.72 
 
 
564 aa  167  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00000269929  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2032  lytic transglycosylase catalytic  31.01 
 
 
528 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277955  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1254  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  29.72 
 
 
564 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000724921  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1259  lytic transglycosylase catalytic  29.93 
 
 
525 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000373485  normal  0.0984249 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1165  lytic transglycosylase, catalytic  31.01 
 
 
529 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000346061  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0807  lytic transglycosylase, catalytic  29.68 
 
 
525 aa  164  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000488034  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1288  lytic transglycosylase, catalytic  29.68 
 
 
525 aa  164  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000451956  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1177  lytic transglycosylase catalytic  31.01 
 
 
529 aa  164  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.00000000111267  normal  0.0154135 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1205  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32 
 
 
426 aa  163  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.627815  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2183  lytic transglycosylase, catalytic  31.03 
 
 
492 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.96919  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2787  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  29.89 
 
 
531 aa  162  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000442386  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0459  putative Signal recognition particle protein (Fifty-four-like protein)  28.26 
 
 
403 aa  161  4e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>