118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0428 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  100 
 
 
1196 aa  2436    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  35.28 
 
 
1232 aa  611  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 
1123 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 
1153 aa  376  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 
1176 aa  343  9e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  27.72 
 
 
1162 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 
1124 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 
1123 aa  310  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  26.47 
 
 
1069 aa  309  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  26.55 
 
 
1173 aa  304  6.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 
1206 aa  287  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  26.49 
 
 
1203 aa  283  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  25.82 
 
 
1125 aa  276  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 
1065 aa  270  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  26.66 
 
 
1141 aa  259  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  26.86 
 
 
1210 aa  253  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 
1149 aa  251  7e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 
1105 aa  246  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  25.17 
 
 
1194 aa  233  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  25.27 
 
 
1162 aa  231  9e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  26.35 
 
 
1257 aa  224  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 
1167 aa  218  5.9999999999999996e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 
1114 aa  215  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  37.32 
 
 
1075 aa  214  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  25.59 
 
 
1122 aa  211  7e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  36.14 
 
 
511 aa  198  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 
1105 aa  196  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  36.34 
 
 
1161 aa  172  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  35.85 
 
 
1195 aa  171  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  34.07 
 
 
1298 aa  167  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 
1041 aa  160  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  32.39 
 
 
1075 aa  157  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  30.09 
 
 
986 aa  140  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2574  hypothetical protein  25.62 
 
 
710 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  32.39 
 
 
1066 aa  134  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  29.75 
 
 
1132 aa  131  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  29.83 
 
 
1052 aa  126  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  29.81 
 
 
1071 aa  125  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  27.78 
 
 
1067 aa  118  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  30.34 
 
 
1068 aa  118  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  29.43 
 
 
1053 aa  114  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  28.7 
 
 
1126 aa  107  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  25.44 
 
 
1194 aa  107  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  27.83 
 
 
1120 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  27.83 
 
 
1122 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  28.81 
 
 
1081 aa  105  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 
1188 aa  105  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  30.7 
 
 
1074 aa  105  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 
1097 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  28.04 
 
 
1125 aa  103  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  28.12 
 
 
1068 aa  99.8  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  29.1 
 
 
966 aa  99  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 
1074 aa  99  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 
897 aa  98.2  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  29.17 
 
 
979 aa  97.8  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  29.27 
 
 
1116 aa  97.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  27.79 
 
 
1109 aa  95.1  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 
1016 aa  94.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  25.67 
 
 
1100 aa  93.2  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  29.69 
 
 
1077 aa  90.1  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  28.02 
 
 
1105 aa  89.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  26.33 
 
 
1056 aa  89.4  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  30.62 
 
 
1041 aa  89.4  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 
991 aa  89  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 
1008 aa  89  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  27.9 
 
 
1129 aa  88.2  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  29.7 
 
 
972 aa  87  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  27.88 
 
 
1071 aa  86.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  25.23 
 
 
1008 aa  86.3  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  28.89 
 
 
1061 aa  83.2  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 
993 aa  82  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  27.1 
 
 
1010 aa  81.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  27.3 
 
 
1001 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  27.22 
 
 
994 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 
1066 aa  77.4  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  28.08 
 
 
1066 aa  77.4  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  26.16 
 
 
992 aa  77  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  24.83 
 
 
1054 aa  77  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 
1026 aa  75.9  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 
888 aa  73.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  23.25 
 
 
1051 aa  72  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  24.83 
 
 
1007 aa  69.7  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  24.43 
 
 
997 aa  69.3  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  25.51 
 
 
1012 aa  69.3  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 
1066 aa  68.2  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 
1010 aa  68.2  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.78 
 
 
1050 aa  67.8  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  25 
 
 
1057 aa  67  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  25.62 
 
 
1007 aa  65.9  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 
966 aa  64.3  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  24.1 
 
 
1008 aa  63.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 
935 aa  63.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 
952 aa  63.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  25.2 
 
 
788 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 
1007 aa  60.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 
1089 aa  58.5  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 
749 aa  56.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 
1087 aa  56.2  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  24.62 
 
 
1008 aa  53.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  25.3 
 
 
1037 aa  52.4  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>