109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0395 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  100 
 
 
1257 aa  2583    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  40.96 
 
 
1298 aa  903    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 
1232 aa  323  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  29.55 
 
 
1075 aa  241  8e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 
1123 aa  235  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 
1149 aa  228  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 
1206 aa  227  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  26.81 
 
 
1125 aa  222  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 
1123 aa  218  7e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  26.26 
 
 
1196 aa  216  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 
1105 aa  210  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  27.25 
 
 
1141 aa  210  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 
1167 aa  200  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  35.78 
 
 
511 aa  190  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 
1176 aa  186  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  25.26 
 
 
1162 aa  175  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  33.44 
 
 
1041 aa  169  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  27.27 
 
 
1069 aa  168  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  24.81 
 
 
1132 aa  167  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  32.46 
 
 
1195 aa  166  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  25.76 
 
 
1203 aa  165  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  35.26 
 
 
1161 aa  162  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  32.21 
 
 
1075 aa  159  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  24.72 
 
 
1210 aa  153  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 
1124 aa  150  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  25.84 
 
 
1194 aa  147  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  30.25 
 
 
986 aa  140  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 
1153 aa  140  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 
1065 aa  139  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  25.72 
 
 
1122 aa  129  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  21.78 
 
 
966 aa  126  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 
1105 aa  124  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 
1114 aa  119  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  28.98 
 
 
1162 aa  114  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  30.09 
 
 
1071 aa  113  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  27.68 
 
 
1173 aa  108  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  25.76 
 
 
979 aa  106  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  22.19 
 
 
1129 aa  106  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  27.48 
 
 
1053 aa  102  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  22.39 
 
 
1008 aa  100  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 
1188 aa  98.6  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  24.83 
 
 
1068 aa  98.6  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  28.72 
 
 
1066 aa  97.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  28.08 
 
 
1010 aa  95.9  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  22.21 
 
 
1008 aa  94.7  9e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  28.03 
 
 
1067 aa  94.7  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 
1016 aa  94.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2574  hypothetical protein  29.96 
 
 
710 aa  93.2  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  22.59 
 
 
992 aa  92.4  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  25.07 
 
 
1068 aa  89.4  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  24.18 
 
 
1097 aa  87  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  25.16 
 
 
1052 aa  85.9  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  26.2 
 
 
1122 aa  85.1  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  26.2 
 
 
1120 aa  84.7  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  27.71 
 
 
1126 aa  84.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  21.6 
 
 
1026 aa  80.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  27.63 
 
 
1077 aa  79.7  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  25.99 
 
 
1125 aa  79.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  25.75 
 
 
1066 aa  78.2  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 
888 aa  77.8  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  23.55 
 
 
1105 aa  76.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 
871 aa  75.5  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  25.55 
 
 
1194 aa  74.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 
1074 aa  74.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  24.32 
 
 
1054 aa  74.3  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  24.84 
 
 
1056 aa  73.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 
1010 aa  72.8  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  23.96 
 
 
1109 aa  71.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  23.02 
 
 
1057 aa  70.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  22.29 
 
 
1074 aa  70.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  24.51 
 
 
1100 aa  69.7  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  26.73 
 
 
1007 aa  68.9  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  21.52 
 
 
1012 aa  68.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 
1066 aa  67.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  23.18 
 
 
1081 aa  67.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 
991 aa  66.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  25.99 
 
 
1051 aa  66.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  22.41 
 
 
1041 aa  62  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  24.68 
 
 
1061 aa  62  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  22.62 
 
 
1007 aa  60.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  24.6 
 
 
1066 aa  60.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  22.93 
 
 
1116 aa  60.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  24.53 
 
 
997 aa  57.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  25.54 
 
 
1071 aa  56.6  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 
897 aa  56.2  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  22.22 
 
 
972 aa  55.8  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  24.38 
 
 
1037 aa  55.1  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  21.29 
 
 
994 aa  54.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 
749 aa  53.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 
1057 aa  53.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  22.89 
 
 
1050 aa  52.8  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  21.79 
 
 
1008 aa  51.6  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  24.62 
 
 
1008 aa  51.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  25.97 
 
 
791 aa  51.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 
952 aa  50.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  26 
 
 
1089 aa  50.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  22.26 
 
 
1001 aa  49.3  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  24.38 
 
 
780 aa  47.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  26.22 
 
 
781 aa  46.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  26.4 
 
 
753 aa  46.6  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>