More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0370 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
805 aa  1625    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.42 
 
 
823 aa  456  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.35 
 
 
813 aa  444  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.3 
 
 
817 aa  420  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.02 
 
 
807 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.26 
 
 
871 aa  412  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.9 
 
 
822 aa  409  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.18 
 
 
805 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  33.9 
 
 
869 aa  393  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  34.27 
 
 
796 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  32.85 
 
 
814 aa  389  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.66 
 
 
816 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.84 
 
 
882 aa  386  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.47 
 
 
807 aa  382  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  33.46 
 
 
819 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  33.17 
 
 
805 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  32.8 
 
 
821 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  32.27 
 
 
797 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.47 
 
 
805 aa  365  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  31.09 
 
 
802 aa  362  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  33.41 
 
 
805 aa  362  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.44 
 
 
862 aa  362  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.48 
 
 
809 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  33.21 
 
 
800 aa  356  6.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  33.13 
 
 
809 aa  356  8.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  32.02 
 
 
831 aa  353  5.9999999999999994e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.53 
 
 
821 aa  353  8e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  31.61 
 
 
804 aa  352  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  33.74 
 
 
803 aa  350  8e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  32.56 
 
 
804 aa  348  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.24 
 
 
805 aa  346  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.06 
 
 
855 aa  343  9e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.53 
 
 
808 aa  340  7e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.26 
 
 
913 aa  338  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  32.15 
 
 
798 aa  334  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.54 
 
 
883 aa  333  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  33.37 
 
 
808 aa  327  6e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  31.81 
 
 
817 aa  326  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.01 
 
 
915 aa  320  7e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.65 
 
 
844 aa  320  7.999999999999999e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  31.54 
 
 
808 aa  318  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  31.7 
 
 
816 aa  319  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.26 
 
 
878 aa  318  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  30.24 
 
 
803 aa  311  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  31.07 
 
 
810 aa  309  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  30.27 
 
 
845 aa  309  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  32.49 
 
 
808 aa  308  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.06 
 
 
893 aa  306  7e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.25 
 
 
812 aa  306  8.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.19 
 
 
874 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  29.71 
 
 
809 aa  300  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  31.72 
 
 
811 aa  299  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  30.12 
 
 
865 aa  298  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  32.13 
 
 
848 aa  298  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.3 
 
 
817 aa  298  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.36 
 
 
879 aa  297  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  31.17 
 
 
810 aa  297  6e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.79 
 
 
810 aa  292  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  30.66 
 
 
887 aa  285  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  30.66 
 
 
808 aa  283  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.13 
 
 
849 aa  281  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  33.01 
 
 
806 aa  278  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.99 
 
 
880 aa  275  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  27.1 
 
 
813 aa  272  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  29.3 
 
 
803 aa  272  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.01 
 
 
919 aa  268  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  29.54 
 
 
843 aa  267  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.86 
 
 
820 aa  267  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  26.13 
 
 
809 aa  263  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  27.59 
 
 
810 aa  262  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  31.53 
 
 
835 aa  258  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  28.67 
 
 
844 aa  256  8e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  30.6 
 
 
887 aa  254  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.34 
 
 
888 aa  251  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.21 
 
 
884 aa  251  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  30.51 
 
 
861 aa  248  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  27.42 
 
 
810 aa  244  6e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  32.4 
 
 
819 aa  242  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  26.63 
 
 
807 aa  228  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  30.08 
 
 
931 aa  221  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26 
 
 
846 aa  214  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.11 
 
 
828 aa  186  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  24.77 
 
 
805 aa  174  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  25.8 
 
 
813 aa  167  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
804 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4627  protein of unknown function DUF214  22.92 
 
 
795 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  24.47 
 
 
816 aa  154  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  24.64 
 
 
810 aa  152  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  24.31 
 
 
770 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1450  protein of unknown function DUF214  24.22 
 
 
789 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264856  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  22.73 
 
 
788 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  27.41 
 
 
795 aa  147  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2156  protein of unknown function DUF214  26.35 
 
 
797 aa  144  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.702076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  24.56 
 
 
806 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  23.84 
 
 
791 aa  137  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3271  protein of unknown function DUF214  23.93 
 
 
795 aa  137  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  0.0322761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0960  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
803 aa  137  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000834077  normal  0.437277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  24.11 
 
 
793 aa  137  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  23.88 
 
 
784 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  24.52 
 
 
808 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.417059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>