More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0369 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
855 aa  1734    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.53 
 
 
874 aa  474  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.39 
 
 
915 aa  452  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.64 
 
 
844 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.72 
 
 
913 aa  416  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.44 
 
 
919 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.53 
 
 
849 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.06 
 
 
878 aa  395  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.26 
 
 
817 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.71 
 
 
823 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  32.11 
 
 
821 aa  366  1e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.91 
 
 
888 aa  363  6e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.65 
 
 
884 aa  362  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  32.53 
 
 
808 aa  357  5.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.56 
 
 
816 aa  356  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.42 
 
 
807 aa  354  4e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.44 
 
 
880 aa  353  8.999999999999999e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.87 
 
 
813 aa  350  8e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.82 
 
 
805 aa  348  3e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  31.4 
 
 
814 aa  343  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  34.3 
 
 
803 aa  342  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  33.14 
 
 
796 aa  342  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  31.88 
 
 
869 aa  339  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  30.93 
 
 
887 aa  337  5e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  32.29 
 
 
811 aa  334  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.44 
 
 
822 aa  333  8e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.69 
 
 
807 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.63 
 
 
882 aa  325  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  32.53 
 
 
808 aa  324  4e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.72 
 
 
805 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.24 
 
 
817 aa  321  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.33 
 
 
805 aa  319  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.57 
 
 
883 aa  319  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.98 
 
 
871 aa  318  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  31.2 
 
 
809 aa  317  6e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  30.5 
 
 
817 aa  315  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  31.74 
 
 
805 aa  315  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.6 
 
 
821 aa  312  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.59 
 
 
805 aa  312  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  30.24 
 
 
802 aa  311  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  30.09 
 
 
831 aa  310  5.9999999999999995e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  31.25 
 
 
816 aa  309  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.01 
 
 
893 aa  309  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  33.41 
 
 
861 aa  308  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  30.68 
 
 
797 aa  308  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  31.45 
 
 
848 aa  307  5.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  31.36 
 
 
887 aa  302  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.12 
 
 
809 aa  301  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.32 
 
 
846 aa  300  9e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  29.5 
 
 
798 aa  297  5e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.31 
 
 
862 aa  297  6e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  31.03 
 
 
804 aa  294  6e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  31.51 
 
 
819 aa  293  8e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  29.91 
 
 
804 aa  290  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  30.94 
 
 
844 aa  289  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  30.43 
 
 
809 aa  284  6.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  31.34 
 
 
805 aa  279  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  30.85 
 
 
806 aa  279  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.78 
 
 
810 aa  277  6e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.47 
 
 
828 aa  277  6e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.94 
 
 
812 aa  276  9e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  28.52 
 
 
803 aa  272  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  31.28 
 
 
808 aa  270  5.9999999999999995e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  29.92 
 
 
810 aa  266  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  29.59 
 
 
865 aa  266  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  28.46 
 
 
845 aa  262  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  30.44 
 
 
800 aa  261  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  31.17 
 
 
835 aa  256  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  28.46 
 
 
803 aa  251  5e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.64 
 
 
808 aa  249  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.25 
 
 
879 aa  239  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  28.26 
 
 
808 aa  235  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  29.72 
 
 
810 aa  234  6e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  29.14 
 
 
931 aa  222  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.73 
 
 
820 aa  222  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  28.78 
 
 
819 aa  205  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  28.51 
 
 
843 aa  205  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  26.85 
 
 
809 aa  202  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  25.17 
 
 
813 aa  202  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  24.86 
 
 
810 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  25.34 
 
 
810 aa  174  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  27.11 
 
 
795 aa  168  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  23.53 
 
 
807 aa  162  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  26 
 
 
788 aa  155  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  24.52 
 
 
798 aa  144  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  24.62 
 
 
804 aa  143  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  24.8 
 
 
809 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  23.47 
 
 
816 aa  137  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  24.87 
 
 
811 aa  136  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  26.46 
 
 
804 aa  134  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  25.76 
 
 
805 aa  134  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  24.92 
 
 
808 aa  134  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  25.12 
 
 
790 aa  134  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  25.98 
 
 
793 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  27.02 
 
 
791 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  25.13 
 
 
800 aa  132  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1753  protein of unknown function DUF214  23.47 
 
 
801 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4622  protein of unknown function DUF214  26.58 
 
 
802 aa  131  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.498775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4627  protein of unknown function DUF214  23.41 
 
 
795 aa  130  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0960  protein of unknown function DUF214  26.02 
 
 
803 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000834077  normal  0.437277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>