More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0367 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
240 aa  497  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  71.43 
 
 
234 aa  343  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  65.09 
 
 
235 aa  318  3.9999999999999996e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  64.66 
 
 
235 aa  318  3.9999999999999996e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  64 
 
 
237 aa  317  7.999999999999999e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2119  ABC transporter, ATP-binding protein  65.2 
 
 
241 aa  302  4.0000000000000003e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  61.19 
 
 
219 aa  275  5e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0775  ABC transporter, ATP-binding protein  58.74 
 
 
243 aa  266  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  56.5 
 
 
235 aa  265  4e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  56.31 
 
 
229 aa  263  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  57.14 
 
 
225 aa  260  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  56.89 
 
 
225 aa  258  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  53.88 
 
 
241 aa  258  4e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  56.62 
 
 
230 aa  258  7e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  55 
 
 
220 aa  257  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  54.46 
 
 
244 aa  256  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  54.95 
 
 
230 aa  255  6e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  53.6 
 
 
226 aa  254  6e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  56.62 
 
 
263 aa  254  7e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  56.16 
 
 
246 aa  254  9e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  56.16 
 
 
247 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  56.16 
 
 
246 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  56.16 
 
 
247 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  55.71 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  56.62 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  55.71 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  55.71 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  55.71 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  51.11 
 
 
237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  56.16 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  52 
 
 
225 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  55.71 
 
 
232 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  55.71 
 
 
243 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  55.71 
 
 
240 aa  250  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  52.94 
 
 
220 aa  248  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  54.26 
 
 
236 aa  248  8e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2239  ABC transporter related  53.24 
 
 
233 aa  248  8e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2406  ABC transporter related  53.88 
 
 
247 aa  248  9e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  54.34 
 
 
240 aa  246  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  51.77 
 
 
228 aa  244  8e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  50.64 
 
 
248 aa  243  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  51.6 
 
 
253 aa  242  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  49.34 
 
 
239 aa  240  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  49.78 
 
 
246 aa  240  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  50 
 
 
230 aa  239  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  49.78 
 
 
242 aa  238  6.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  54.26 
 
 
238 aa  238  8e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  52.89 
 
 
229 aa  238  9e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2990  hypothetical protein  53.12 
 
 
229 aa  237  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  49.11 
 
 
230 aa  236  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2600  ABC transporter related  53.18 
 
 
227 aa  236  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  47.83 
 
 
244 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  49.78 
 
 
225 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  49.12 
 
 
242 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  50.68 
 
 
237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  49.78 
 
 
228 aa  232  4.0000000000000004e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  48.9 
 
 
241 aa  231  8.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0951  ABC transporter related  50.44 
 
 
234 aa  229  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  51.33 
 
 
233 aa  228  5e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  50.67 
 
 
255 aa  227  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  50.68 
 
 
248 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  48.89 
 
 
238 aa  227  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
226 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  50.68 
 
 
248 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  51.6 
 
 
238 aa  226  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  47.16 
 
 
236 aa  226  3e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  48.46 
 
 
241 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  48.02 
 
 
241 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
226 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  48.86 
 
 
226 aa  226  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  46.67 
 
 
266 aa  225  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
226 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  48.86 
 
 
226 aa  224  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 
226 aa  224  7e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  48.86 
 
 
226 aa  224  7e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 
226 aa  224  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 
226 aa  224  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  48.86 
 
 
226 aa  224  7e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 
226 aa  224  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
226 aa  224  8e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  50 
 
 
233 aa  224  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  50.44 
 
 
233 aa  224  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  48.66 
 
 
657 aa  223  1e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  48 
 
 
235 aa  224  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 
233 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  50.9 
 
 
244 aa  224  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  46.93 
 
 
253 aa  223  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  49.77 
 
 
230 aa  223  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  47.06 
 
 
234 aa  223  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  49.77 
 
 
253 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.93 
 
 
647 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  48.66 
 
 
235 aa  222  3e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  46.7 
 
 
248 aa  223  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  50.66 
 
 
256 aa  222  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  46.88 
 
 
231 aa  223  3e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  47.77 
 
 
225 aa  222  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  46.9 
 
 
249 aa  222  4e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  45.81 
 
 
244 aa  222  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  46.26 
 
 
230 aa  222  4e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  47.83 
 
 
239 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>