More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0341 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 		 874 aa  1766    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.48 
 
 		 915 aa  518  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.53 
 
 		 855 aa  478  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.12 
 
 		 844 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.42 
 
 		 849 aa  445  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.47 
 
 		 913 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.57 
 
 		 919 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.62 
 
 		 888 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.67 
 
 		 817 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.8 
 
 		 805 aa  365  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.1 
 
 		 807 aa  364  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  32.7 
 
 		 821 aa  364  5.0000000000000005e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.16 
 
 		 878 aa  362  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.67 
 
 		 805 aa  359  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  33.45 
 
 		 796 aa  358  2.9999999999999997e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  32.51 
 
 		 869 aa  357  6.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  32.23 
 
 		 811 aa  347  5e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  31.38 
 
 		 814 aa  346  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.51 
 
 		 813 aa  343  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  31.37 
 
 		 797 aa  342  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  32.27 
 
 		 808 aa  337  5e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.01 
 
 		 817 aa  335  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.2 
 
 		 871 aa  334  4e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  30.49 
 
 		 831 aa  334  5e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  31.12 
 
 		 798 aa  333  9e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  32.28 
 
 		 845 aa  333  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.33 
 
 		 816 aa  332  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.37 
 
 		 822 aa  332  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  32.28 
 
 		 803 aa  329  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.67 
 
 		 809 aa  330  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.82 
 
 		 821 aa  325  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  30.84 
 
 		 817 aa  325  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  29.17 
 
 		 804 aa  323  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.8 
 
 		 823 aa  323  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.21 
 
 		 882 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.7 
 
 		 893 aa  318  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  31.52 
 
 		 808 aa  318  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  31.71 
 
 		 809 aa  315  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.97 
 
 		 805 aa  313  7.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.31 
 
 		 807 aa  311  4e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.19 
 
 		 805 aa  308  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  31.38 
 
 		 800 aa  308  4.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.56 
 
 		 862 aa  305  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  29.47 
 
 		 805 aa  303  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  29.45 
 
 		 804 aa  302  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  31.54 
 
 		 861 aa  302  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.34 
 
 		 883 aa  302  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.13 
 
 		 812 aa  298  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  30.19 
 
 		 848 aa  296  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  30.09 
 
 		 816 aa  293  9e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.57 
 
 		 880 aa  291  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  27.24 
 
 		 802 aa  291  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  31.3 
 
 		 806 aa  289  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  28.89 
 
 		 887 aa  286  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  27.59 
 
 		 809 aa  286  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.56 
 
 		 884 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  30.19 
 
 		 819 aa  278  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.15 
 
 		 808 aa  277  8e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  30.07 
 
 		 808 aa  276  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  29.43 
 
 		 865 aa  275  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  29.52 
 
 		 805 aa  273  8.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  29.37 
 
 		 808 aa  272  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  28.09 
 
 		 810 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.78 
 
 		 846 aa  267  5e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 		 813 aa  265  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  30.25 
 
 		 887 aa  264  4.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  28.43 
 
 		 803 aa  263  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  29.61 
 
 		 843 aa  259  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  28.52 
 
 		 844 aa  257  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.7 
 
 		 828 aa  255  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  28.08 
 
 		 803 aa  253  8.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  29.78 
 
 		 835 aa  242  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.87 
 
 		 820 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.86 
 
 		 810 aa  229  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.89 
 
 		 879 aa  229  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  29.37 
 
 		 819 aa  229  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  29.44 
 
 		 810 aa  225  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  25.79 
 
 		 810 aa  214  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  24.94 
 
 		 809 aa  211  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  28.3 
 
 		 931 aa  204  8e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  24.75 
 
 		 807 aa  195  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  26.19 
 
 		 810 aa  186  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  26.89 
 
 		 808 aa  148  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  27.36 
 
 		 806 aa  147  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  25.87 
 
 		 805 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1450  protein of unknown function DUF214  26.76 
 
 		 789 aa  146  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264856  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  24.91 
 
 		 811 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  26.31 
 
 		 770 aa  144  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  25.47 
 
 		 793 aa  142  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  27.01 
 
 		 795 aa  140  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  26.78 
 
 		 784 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  26.61 
 
 		 802 aa  139  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  27.21 
 
 		 810 aa  138  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  25.74 
 
 		 791 aa  137  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2089  protein of unknown function DUF214  24.22 
 
 		 794 aa  137  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  26.68 
 
 		 805 aa  136  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 788 aa  135  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  25.19 
 
 		 793 aa  135  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7257  protein of unknown function DUF214  24.95 
 
 		 798 aa  134  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506744  normal  0.498638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  25.54 
 
 		 790 aa  132  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.424889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>