More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0322 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0322  ribulokinase  100 
 
 		 529 aa  1089    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.54265 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1748  L-ribulokinase  39.04 
 
 		 570 aa  356  5e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0469  L-ribulokinase  39.64 
 
 		 562 aa  351  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1383  carbohydrate kinase FGGY  40.33 
 
 		 553 aa  333  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.396144  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2398  ribulokinase  37.1 
 
 		 554 aa  292  9e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2729  ribulokinase  35.11 
 
 		 557 aa  271  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0860748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1239  L-ribulokinase  37.22 
 
 		 544 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.711611  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1997  ribulokinase  33.33 
 
 		 557 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00226612  unclonable  0.0000285081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1977  ribulokinase  33.33 
 
 		 557 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489271  normal  0.124359 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3994  ribulokinase  34.69 
 
 		 547 aa  252  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.026407  normal  0.515054 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2064  ribulokinase  32.97 
 
 		 557 aa  252  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000583792  hitchhiker  0.00000400193 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1119  ribulokinase  34.35 
 
 		 563 aa  250  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0065  ribulokinase  33.83 
 
 		 566 aa  247  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.268824  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0067  ribulokinase  33.83 
 
 		 566 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2150  ribulokinase  33.89 
 
 		 561 aa  244  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0110  ribulokinase  34.01 
 
 		 569 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.407492 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2068  ribulokinase  32.65 
 
 		 557 aa  244  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000109649  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0068  ribulokinase  33.64 
 
 		 566 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0114  ribulokinase  34.01 
 
 		 569 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2138  ribulokinase  31.73 
 
 		 557 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000886858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0055  ribulokinase  33.64 
 
 		 566 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0114  ribulokinase  34.01 
 
 		 569 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.728567  normal  0.199883 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0065  ribulokinase  33.64 
 
 		 566 aa  243  5e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703841  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3536  L-ribulokinase  33.64 
 
 		 566 aa  242  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2899  ribulokinase  34.08 
 
 		 564 aa  242  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2229  ribulokinase  32.09 
 
 		 556 aa  242  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00201608  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0109  ribulokinase  33.64 
 
 		 569 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.526121 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1913  ribulokinase  32.61 
 
 		 563 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0107  ribulokinase  33.64 
 
 		 569 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00064  hypothetical protein  33.64 
 
 		 566 aa  240  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00065  ribulokinase  33.64 
 
 		 566 aa  240  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3594  ribulokinase  33.64 
 
 		 566 aa  240  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  unclonable  0.0000000207418 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0772  ribulokinase  33.7 
 
 		 555 aa  232  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289465  normal  0.0721691 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0610  ribulokinase  32.74 
 
 		 569 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.59168  normal  0.0130922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2244  ribulokinase  33.84 
 
 		 561 aa  229  9e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000378483 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0222  ribulokinase  32.87 
 
 		 585 aa  226  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2735  ribulokinase  31.69 
 
 		 564 aa  226  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0379  ribulokinase  33.1 
 
 		 577 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1886  ribulokinase  33.02 
 
 		 567 aa  223  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2000  ribulokinase  33.02 
 
 		 567 aa  223  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2260  ribulokinase  33.21 
 
 		 567 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2028  ribulokinase  32.86 
 
 		 566 aa  221  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2328  ribulokinase  32.43 
 
 		 561 aa  219  7e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.717487  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0380  ribulokinase  35.81 
 
 		 567 aa  219  7.999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.526871  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3201  ribulokinase  34.13 
 
 		 564 aa  219  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.995888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1861  ribulokinase  34.32 
 
 		 554 aa  217  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3662  ribulokinase  31.67 
 
 		 562 aa  217  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3274  ribulokinase  35.45 
 
 		 598 aa  216  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187785  normal  0.0296673 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0589  ribulokinase  28.38 
 
 		 546 aa  209  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0575  ribulokinase  28.38 
 
 		 546 aa  209  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4715  ribulokinase  33.27 
 
 		 556 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6219  ribulokinase  33.9 
 
 		 551 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0749  L-ribulokinase  33.7 
 
 		 572 aa  202  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2886  L-ribulokinase  32.86 
 
 		 556 aa  196  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06940  L-ribulokinase  31.88 
 
 		 579 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0871  ribulokinase  33.77 
 
 		 564 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1927  ribulokinase  27.37 
 
 		 536 aa  179  8e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2057  carbohydrate kinase FGGY  31.52 
 
 		 517 aa  163  8.000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.795187 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  29.41 
 
 		 497 aa  159  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  28.63 
 
 		 502 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0368  pentulose kinase  27.51 
 
 		 545 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0435  FGGY-family pentulose kinase  27.51 
 
 		 545 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1227  pentulose kinase  27.51 
 
 		 545 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.838114 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4697  FGGY-family pentulose kinase  28.36 
 
 		 545 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.921712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  25.78 
 
 		 497 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1346  pentulose kinase  29.22 
 
 		 526 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.664914  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  28.16 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3921  FGGY-family pentulose kinase  26.72 
 
 		 528 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0555  ribulokinase  26.28 
 
 		 544 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3411  FGGY-family pentulose kinase  26.92 
 
 		 525 aa  124  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110951  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  25.29 
 
 		 518 aa  123  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3746  FGGY-family pentulose kinase  28.52 
 
 		 527 aa  123  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  25.63 
 
 		 509 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0456  FGGY-family pentulose kinase  26.45 
 
 		 547 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.708838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  24.02 
 
 		 503 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3705  D-ribulokinase  26.68 
 
 		 544 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  27.06 
 
 		 504 aa  117  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  25.44 
 
 		 509 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0680  pentulose kinase  26.36 
 
 		 547 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3574  ribitol kinase  27.92 
 
 		 523 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197802  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4175  carbohydrate kinase, FGGY  28.21 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.929603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  25.77 
 
 		 548 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2495  FGGY-family pentulose kinase  27.02 
 
 		 543 aa  115  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.578248  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6255  FGGY-family pentulose kinase  27.22 
 
 		 545 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0847  FGGY-family pentulose kinase  27.24 
 
 		 543 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0389776  normal  0.126532 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  26.13 
 
 		 538 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  24.43 
 
 		 511 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  26.31 
 
 		 501 aa  114  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3440  FGGY-family pentulose kinase  25.87 
 
 		 544 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243574  normal  0.308227 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  27.11 
 
 		 506 aa  114  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  25.05 
 
 		 506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  24.47 
 
 		 506 aa  111  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3784  FGGY-family pentulose kinase  25.93 
 
 		 529 aa  110  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0121132  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  26.61 
 
 		 524 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  25.74 
 
 		 514 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  23.45 
 
 		 500 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  26.17 
 
 		 512 aa  108  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3444  FGGY-family pentulose kinase  27.31 
 
 		 527 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  26.95 
 
 		 482 aa  108  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  25.98 
 
 		 498 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>