More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0297 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
813 aa  1644    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  39.83 
 
 
817 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  39.3 
 
 
814 aa  540  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.36 
 
 
823 aa  519  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  39.02 
 
 
869 aa  519  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.39 
 
 
816 aa  503  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.83 
 
 
882 aa  505  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.82 
 
 
807 aa  498  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.62 
 
 
805 aa  490  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  35.28 
 
 
821 aa  483  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.58 
 
 
807 aa  482  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.33 
 
 
871 aa  477  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.59 
 
 
822 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.85 
 
 
805 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  36.49 
 
 
796 aa  462  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  36.24 
 
 
805 aa  460  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  36.99 
 
 
831 aa  455  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  35.39 
 
 
809 aa  443  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.33 
 
 
805 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.48 
 
 
809 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.35 
 
 
805 aa  438  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.67 
 
 
808 aa  432  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  35.19 
 
 
804 aa  429  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.55 
 
 
821 aa  423  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.58 
 
 
862 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  35.09 
 
 
819 aa  416  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  35.64 
 
 
800 aa  415  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  35.76 
 
 
805 aa  415  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  31.39 
 
 
797 aa  411  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  31.01 
 
 
809 aa  401  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  33.82 
 
 
816 aa  402  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  36.59 
 
 
803 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  32.66 
 
 
845 aa  399  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  34.83 
 
 
798 aa  397  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  31.99 
 
 
802 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  33.86 
 
 
804 aa  385  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.6 
 
 
893 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  34.55 
 
 
808 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.53 
 
 
878 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  32.57 
 
 
817 aa  379  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.57 
 
 
879 aa  372  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  34.85 
 
 
808 aa  371  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  33.73 
 
 
865 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.58 
 
 
883 aa  369  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  34.29 
 
 
808 aa  360  5e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  32.77 
 
 
810 aa  358  2.9999999999999997e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  35.59 
 
 
806 aa  356  1e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.41 
 
 
915 aa  355  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  34.07 
 
 
810 aa  353  5.9999999999999994e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.87 
 
 
855 aa  350  4e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.92 
 
 
844 aa  349  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.37 
 
 
810 aa  346  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.74 
 
 
913 aa  345  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.5 
 
 
849 aa  345  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.51 
 
 
874 aa  344  4e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  30.91 
 
 
803 aa  342  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  32.22 
 
 
811 aa  338  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  31.32 
 
 
887 aa  337  5.999999999999999e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  32.61 
 
 
887 aa  332  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.37 
 
 
820 aa  329  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  31.33 
 
 
843 aa  323  5e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  31.47 
 
 
808 aa  323  6e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  31.82 
 
 
819 aa  322  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  30.01 
 
 
803 aa  319  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  28.43 
 
 
813 aa  313  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.01 
 
 
812 aa  309  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.67 
 
 
817 aa  309  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  33.83 
 
 
861 aa  308  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  27.38 
 
 
809 aa  306  8.000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.53 
 
 
919 aa  306  9.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  28.12 
 
 
810 aa  297  6e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.49 
 
 
880 aa  293  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.34 
 
 
888 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  32.33 
 
 
835 aa  290  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  27.57 
 
 
810 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.66 
 
 
884 aa  288  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.4 
 
 
846 aa  276  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  29.63 
 
 
844 aa  273  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  30.98 
 
 
848 aa  263  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  26.74 
 
 
807 aa  262  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.15 
 
 
828 aa  232  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  29.26 
 
 
931 aa  204  7e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  24.13 
 
 
808 aa  149  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  23.46 
 
 
806 aa  140  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4614  protein of unknown function DUF214  24.26 
 
 
801 aa  137  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.122129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  23.27 
 
 
792 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  24.61 
 
 
805 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  25.09 
 
 
805 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  24.68 
 
 
800 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4610  protein of unknown function DUF214  23.94 
 
 
798 aa  129  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.22275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  23.58 
 
 
798 aa  129  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  23.31 
 
 
804 aa  127  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  22.98 
 
 
793 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0330  acetylornithine deacetylase ArgE  24.7 
 
 
835 aa  125  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.277971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  25.49 
 
 
800 aa  124  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2744  protein of unknown function DUF214  24.31 
 
 
799 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  22.7 
 
 
802 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  23.49 
 
 
816 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  23.73 
 
 
804 aa  120  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  22.35 
 
 
784 aa  120  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>