More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0285 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 		 356 aa  708    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  28.41 
 
 		 360 aa  143  5e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  27.86 
 
 		 360 aa  139  7e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  29.82 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 		 367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  29.2 
 
 		 339 aa  134  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  26.84 
 
 		 363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  29.62 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  28.01 
 
 		 358 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 344 aa  97.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 		 257 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  32.23 
 
 		 261 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0259  ABC transporter  25.6 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.474488  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  33.5 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  21.72 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  25.86 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.19 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 		 247 aa  79  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 		 261 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  27.05 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  24.19 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0276  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  29.95 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  31.31 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  27.05 
 
 		 250 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 		 269 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  20.98 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  22.32 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0553  ABC-2 type transporter  24.09 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  29.29 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  26.21 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  27.23 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0539  ABC-2 type transporter  24.09 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  24.76 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  30.86 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  24.11 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  29.15 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  22.55 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  30.93 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  24.75 
 
 		 253 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  26.73 
 
 		 251 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  25.24 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  21.2 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  26.06 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  23.06 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  24.1 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0967  ABC-2 type transporter  26.49 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  22.26 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  24.47 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  22.74 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0567  ABC-2 type transporter  25.99 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.04 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  21.81 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  22.38 
 
 		 381 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  27.64 
 
 		 269 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  21.14 
 
 		 365 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  27.84 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  25.24 
 
 		 276 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  22.09 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  24.12 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2004  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 257 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.63 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  22.61 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  25.25 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  29.29 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.54 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  23.08 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  22.49 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  24.12 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  22.49 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  21.73 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  25.26 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  22.7 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.36 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  24.63 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  21.73 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  25.26 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  21.52 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  24.22 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13310  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.06 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.455926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  25.52 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  26.7 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  28.98 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  19.57 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>