159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0206 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
625 aa  1288    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1899  hypothetical protein  49.23 
 
 
561 aa  543  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.131383  hitchhiker  0.000892254 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  42.35 
 
 
554 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  43.8 
 
 
557 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  45.56 
 
 
540 aa  364  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3586  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.83 
 
 
525 aa  350  4e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0148  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.55 
 
 
533 aa  330  7e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246711  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.14 
 
 
533 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0008  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.38 
 
 
516 aa  318  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000297379 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2592  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.66 
 
 
543 aa  318  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000115115  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.82 
 
 
549 aa  263  6.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.6 
 
 
565 aa  259  7e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.97 
 
 
559 aa  258  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.4 
 
 
566 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  36.27 
 
 
598 aa  257  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.82 
 
 
547 aa  254  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.27 
 
 
563 aa  252  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 
560 aa  249  7e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.47 
 
 
540 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.12 
 
 
560 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.13 
 
 
560 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.91 
 
 
560 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  32.63 
 
 
571 aa  238  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.69 
 
 
599 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.2 
 
 
560 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0991  hypothetical protein  32.53 
 
 
811 aa  230  7e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.95434 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.58 
 
 
549 aa  224  4e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  31.52 
 
 
546 aa  223  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.52 
 
 
546 aa  223  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  31.83 
 
 
661 aa  223  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.88 
 
 
544 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2331  hypothetical protein  33.25 
 
 
519 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  31.78 
 
 
563 aa  218  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  30.98 
 
 
563 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.31 
 
 
540 aa  217  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.4 
 
 
556 aa  216  7e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3935  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.86 
 
 
534 aa  216  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444109  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.4 
 
 
670 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  27.34 
 
 
558 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1428  hypothetical protein  30.04 
 
 
718 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2224  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.53 
 
 
668 aa  213  9e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  37.12 
 
 
546 aa  213  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1223  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.37 
 
 
775 aa  213  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213789  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.28 
 
 
526 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.8 
 
 
724 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.257633  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1328  hypothetical protein  29.5 
 
 
539 aa  211  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0952  cell wall degradation protein  30.08 
 
 
656 aa  209  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.94 
 
 
716 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281728  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4967  hypothetical protein  33.88 
 
 
523 aa  209  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  31.97 
 
 
536 aa  207  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.62 
 
 
629 aa  207  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294872 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0141  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.23 
 
 
624 aa  205  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.764176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2235  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.06 
 
 
637 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.328672 
 
 
-
 
NC_004310  BR0962  hypothetical protein  29.68 
 
 
572 aa  204  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.918601  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2875  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.87 
 
 
662 aa  204  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.929395  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2145  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.25 
 
 
531 aa  202  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535243  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2068  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.48 
 
 
672 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494147  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2015  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.43 
 
 
636 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2979  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.67 
 
 
648 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.32051  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6864  hypothetical protein  28.91 
 
 
702 aa  200  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.337654  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1781  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.1 
 
 
500 aa  200  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0274269 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  38.32 
 
 
419 aa  200  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.56 
 
 
549 aa  200  7e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3150  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.8 
 
 
654 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0041  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.19 
 
 
506 aa  198  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0945132  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2752  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.67 
 
 
646 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3376  hypothetical protein  31.1 
 
 
537 aa  197  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.925793  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3977  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.09 
 
 
730 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1240  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.27 
 
 
535 aa  196  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.770213 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2531  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.38 
 
 
433 aa  196  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.63 
 
 
443 aa  193  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  28.94 
 
 
530 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2805  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.15 
 
 
674 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75853  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3909  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.29 
 
 
595 aa  190  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0227727  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  27.19 
 
 
568 aa  189  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2078  hypothetical protein  28.3 
 
 
614 aa  189  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142171  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5311  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.61 
 
 
602 aa  188  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6595  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.77 
 
 
553 aa  188  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.775034 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0757  putative peptidoglycan-binding protein  36.05 
 
 
446 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1575  hypothetical protein  28.49 
 
 
631 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00305451  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4769  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.7 
 
 
590 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5236  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.7 
 
 
586 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0586878 
 
 
-
 
NC_004310  BR0762  peptidoglycan-binding protein, putative  35.74 
 
 
433 aa  183  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1609  hypothetical protein  34.85 
 
 
410 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1789  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.45 
 
 
571 aa  180  7e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.385253  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1892  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.32 
 
 
484 aa  177  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.313593  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1176  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.86 
 
 
433 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0293552  normal  0.0832546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1265  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.39 
 
 
433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469401  normal  0.170975 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  32.23 
 
 
563 aa  174  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.81 
 
 
458 aa  172  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1726  hypothetical protein  36.81 
 
 
613 aa  171  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131487  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1223  hypothetical protein  36.52 
 
 
318 aa  170  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41715  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1957  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.12 
 
 
451 aa  170  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.732042  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1612  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.42 
 
 
472 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185448  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2563  hypothetical protein  36.12 
 
 
618 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593956  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2654  hypothetical protein  36.12 
 
 
618 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.334629  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1898  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.25 
 
 
521 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.25 
 
 
521 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1973  hypothetical protein  36.12 
 
 
596 aa  169  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.221768  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1327  hypothetical protein  32.61 
 
 
512 aa  168  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.592833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>