More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0184 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 480 aa  989    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 467 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 468 aa  442  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 490 aa  439  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 465 aa  435  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 494 aa  429  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 463 aa  430  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 466 aa  428  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 479 aa  428  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 469 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 		 466 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 471 aa  408  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 471 aa  408  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 467 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 464 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  43.59 
 
 		 471 aa  408  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 471 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 471 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 471 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 471 aa  408  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 471 aa  408  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  43.42 
 
 		 495 aa  411  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 467 aa  410  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 471 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 471 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 471 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 471 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 471 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 471 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 471 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 		 467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 471 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 471 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 470 aa  408  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 470 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 		 464 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2931  glutamyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 471 aa  405  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000400457  normal  0.117314 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 501 aa  405  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 487 aa  403  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 509 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 470 aa  401  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 466 aa  398  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 471 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 466 aa  398  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 482 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 484 aa  392  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 471 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 		 496 aa  392  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 475 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 484 aa  392  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3417  glutamyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 469 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 495 aa  389  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 480 aa  391  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 472 aa  391  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 469 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 472 aa  386  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 473 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 468 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 467 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 492 aa  386  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 469 aa  388  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 480 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 475 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 464 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 469 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 481 aa  379  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 491 aa  381  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 465 aa  379  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0456  glutamyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2350  glutamyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 474 aa  381  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 468 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 488 aa  378  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 469 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 472 aa  378  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 472 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 474 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 474 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 471 aa  376  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 474 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2906  glutamyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 469 aa  376  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000836575  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 469 aa  378  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 470 aa  372  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 488 aa  374  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 469 aa  375  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 485 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 470 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 470 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2947  glutamyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 469 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000528448  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2802  glutamyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 469 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000260001  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 469 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1365  glutamyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 469 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000124879  normal  0.0325353 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 469 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 469 aa  371  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1554  glutamyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 469 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000003282  normal  0.0351282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2822  glutamyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 469 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000059188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>