230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0148 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  100 
 
 		 244 aa  480  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  36.82 
 
 		 255 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  44.34 
 
 		 582 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3657  hypothetical protein  39.42 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  35.48 
 
 		 217 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3878  TonB-like protein  44.74 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.781736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2101  TonB-like protein  50 
 
 		 487 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4364  hypothetical protein  36.27 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  40.45 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  40.45 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  39.33 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  33.33 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  40 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  39.33 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  40.45 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  39.33 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2113  TonB-like protein  37.18 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  40.24 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  32.37 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  39.47 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  33.33 
 
 		 249 aa  62  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  30 
 
 		 206 aa  62  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  37.18 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0038  TonB-like protein  41.1 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  32.14 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  35.29 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  29.71 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  35.16 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  35.79 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  33.03 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  32.89 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  35.79 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  27.39 
 
 		 287 aa  58.5  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  34.57 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  33.73 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  35.8 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  38.46 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  34.52 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1218  TonB-like protein  39.02 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0834561  normal  0.166487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1775  TonB-like protein  38.98 
 
 		 122 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  34.52 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  34.52 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  33.33 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  34.52 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  33.33 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  31.33 
 
 		 370 aa  55.8  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  38.55 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  38.96 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  33.75 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  33.33 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  38.96 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  26.53 
 
 		 390 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  34.52 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  33.72 
 
 		 368 aa  55.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  34.52 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  34.52 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  33.33 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  28.46 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  32.31 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  31.33 
 
 		 369 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  31.76 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  38.64 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  37.35 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  31.4 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0810  TonB-like protein  33.33 
 
 		 614 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  32.14 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  32.14 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  33.33 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  29.76 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4405  TonB-like protein  44.26 
 
 		 160 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  43.86 
 
 		 334 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  33.33 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  35.9 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  29.09 
 
 		 288 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  33.33 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  29.41 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  33.73 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  30.12 
 
 		 370 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  37.7 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  35.23 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  31.71 
 
 		 207 aa  52.8  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  36.78 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  34.12 
 
 		 392 aa  52.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  37.97 
 
 		 245 aa  52.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  36.78 
 
 		 233 aa  52.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  30.12 
 
 		 370 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  35 
 
 		 280 aa  52  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  32.95 
 
 		 273 aa  52  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  30.49 
 
 		 112 aa  52  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  30.59 
 
 		 226 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  39.08 
 
 		 256 aa  52  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  33.73 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  31.46 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3133  TonB-like protein  37.5 
 
 		 342 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  30.23 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  37.66 
 
 		 117 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  30.23 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  28.57 
 
 		 230 aa  52  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>