More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0147 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0147  protein translocase subunit secF  100 
 
 		 404 aa  819    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000009249  hitchhiker  0.00252765 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1324  protein-export membrane protein SecF  34.88 
 
 		 400 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0920366  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  47.17 
 
 		 307 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1411  protein-export membrane protein SecF  36.05 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1310  protein-export membrane protein SecF  36.05 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2539  protein translocase subunit secF  35.68 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0110788  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  39.92 
 
 		 323 aa  194  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  39.92 
 
 		 323 aa  193  4e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  39.92 
 
 		 323 aa  193  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  53.65 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  33.5 
 
 		 357 aa  192  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  39.92 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0682  protein-export membrane protein SecF  33.6 
 
 		 357 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  43.75 
 
 		 307 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  51.7 
 
 		 304 aa  188  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  51.7 
 
 		 304 aa  188  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  46.23 
 
 		 323 aa  187  4e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  38.89 
 
 		 323 aa  187  4e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  50 
 
 		 316 aa  187  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  41.84 
 
 		 322 aa  186  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  53.63 
 
 		 762 aa  185  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  55.23 
 
 		 313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  48.88 
 
 		 759 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  45.88 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  49.48 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  57.31 
 
 		 312 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  45.88 
 
 		 316 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  48.31 
 
 		 785 aa  180  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  48.31 
 
 		 785 aa  180  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  51.76 
 
 		 303 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  32.88 
 
 		 312 aa  179  8e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0847  protein-export membrane protein SecF  40.8 
 
 		 359 aa  178  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0561071  normal  0.116765 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  51.76 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  41.71 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  38.37 
 
 		 328 aa  177  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  49.45 
 
 		 315 aa  177  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  49.72 
 
 		 315 aa  176  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2443  preprotein translocase subunit SecF  42.73 
 
 		 347 aa  176  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105757  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  46.94 
 
 		 308 aa  176  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  39.18 
 
 		 301 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  33.78 
 
 		 322 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  50.59 
 
 		 302 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1898  protein translocase subunit secF  51.18 
 
 		 314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.970453 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  47.67 
 
 		 305 aa  173  5e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  50 
 
 		 302 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.26 
 
 		 856 aa  173  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  51.79 
 
 		 315 aa  173  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  47.57 
 
 		 310 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  34.93 
 
 		 315 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  30.34 
 
 		 323 aa  172  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.86 
 
 		 846 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2856  protein-export membrane protein SecF  43.62 
 
 		 318 aa  172  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.114618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  49.41 
 
 		 302 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  51.19 
 
 		 315 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  30.89 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0540  preprotein translocase subunit SecF  33.16 
 
 		 361 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0258314 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  50.89 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.78 
 
 		 844 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.92 
 
 		 853 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3517  preprotein translocase subunit SecF  49.73 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.943932  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  42.11 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  33.85 
 
 		 316 aa  170  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3993  preprotein translocase subunit SecF  44.85 
 
 		 316 aa  170  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117459  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40450  preprotein translocase subunit SecF  50.25 
 
 		 304 aa  170  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.193489  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  50 
 
 		 315 aa  169  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  47.62 
 
 		 311 aa  169  8e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  39.56 
 
 		 323 aa  169  8e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  48.31 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  41.71 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1759  preprotein translocase subunit SecF  50.28 
 
 		 315 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.020465  normal  0.0122623 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1002  protein-export membrane protein SecF  43.78 
 
 		 319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  43.81 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2211  preprotein translocase subunit SecF  41.46 
 
 		 314 aa  167  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.220964 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  47.89 
 
 		 313 aa  167  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  48.88 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  43.46 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  48.88 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  45.25 
 
 		 759 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  48.88 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2889  preprotein translocase subunit SecF  50.85 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000629469 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  48.88 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  47.19 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  48.88 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  48.31 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  48.31 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  48.31 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  43.01 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  48.31 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  48.31 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  48.31 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  48.31 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  48.31 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  48.31 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2960  preprotein translocase subunit SecF  30.03 
 
 		 323 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2528  preprotein translocase subunit SecF  45.83 
 
 		 316 aa  166  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  44.32 
 
 		 307 aa  166  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.53 
 
 		 844 aa  166  9e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1819  preprotein translocase subunit SecF  34.03 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814771  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  42.05 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1408  protein translocase subunit secF  31.9 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>