More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0144 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0144  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
384 aa  799    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0518824  decreased coverage  0.000581764 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.89 
 
 
373 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.04 
 
 
373 aa  432  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.79 
 
 
370 aa  433  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.91 
 
 
372 aa  433  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.68 
 
 
372 aa  431  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.45 
 
 
375 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.43 
 
 
355 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.65 
 
 
371 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.49 
 
 
380 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.12 
 
 
373 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.02 
 
 
374 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.95 
 
 
407 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.37 
 
 
375 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.76 
 
 
386 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.04 
 
 
377 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.51 
 
 
371 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.27 
 
 
379 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.55 
 
 
379 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.55 
 
 
379 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.55 
 
 
379 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.55 
 
 
379 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.55 
 
 
379 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.55 
 
 
379 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.55 
 
 
379 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.27 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.27 
 
 
379 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.71 
 
 
374 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.72 
 
 
379 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.3 
 
 
370 aa  404  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  53.72 
 
 
371 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.47 
 
 
394 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.3 
 
 
370 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.74 
 
 
382 aa  401  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1215  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.99 
 
 
385 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.557932 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.23 
 
 
371 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.02 
 
 
372 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.49 
 
 
373 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.1 
 
 
357 aa  395  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.79 
 
 
377 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.09 
 
 
370 aa  395  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.75 
 
 
369 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2191  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.23 
 
 
371 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.314247 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1321  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.82 
 
 
391 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.49 
 
 
380 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3407  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.93 
 
 
370 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38542  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.93 
 
 
374 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  0.0000118913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.93 
 
 
374 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000328041  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.93 
 
 
374 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.23 
 
 
374 aa  391  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3113  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.66 
 
 
374 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2647  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.1 
 
 
381 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000956702  hitchhiker  0.00180241 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.46 
 
 
376 aa  391  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1401  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.52 
 
 
377 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000397481  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.66 
 
 
374 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000574895  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.52 
 
 
377 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2702  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.1 
 
 
374 aa  388  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000654614  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
379 aa  390  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2882  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.1 
 
 
374 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000363226  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2787  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.1 
 
 
374 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000135544  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3054  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.06 
 
 
379 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0377683  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2807  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.1 
 
 
374 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 
392 aa  385  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.91 
 
 
380 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
373 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2335  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.82 
 
 
386 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.0584055 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.96 
 
 
376 aa  386  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1156  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.23 
 
 
388 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10772  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0770  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.04 
 
 
376 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.196276 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1570  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.1 
 
 
374 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000109087  hitchhiker  0.000000108069 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1340  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.79 
 
 
376 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.20108  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.26 
 
 
379 aa  386  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.42 
 
 
375 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.42 
 
 
375 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.42 
 
 
375 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.42 
 
 
375 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0084  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.11 
 
 
384 aa  384  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000052368  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1495  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.95 
 
 
376 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3520  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.06 
 
 
377 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1241  normal  0.323798 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  50.42 
 
 
375 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2804  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.23 
 
 
376 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5516  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.95 
 
 
378 aa  383  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.575246  normal  0.110297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0280  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.08 
 
 
375 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2520  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.37 
 
 
376 aa  382  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783169  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.54 
 
 
379 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.54 
 
 
379 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.42 
 
 
375 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.42 
 
 
375 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2337  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 
374 aa  383  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00144843  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.42 
 
 
375 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.39 
 
 
370 aa  383  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.42 
 
 
375 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3296  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.96 
 
 
383 aa  381  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300958  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0045  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.95 
 
 
376 aa  382  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.75 
 
 
373 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.95 
 
 
395 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
381 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1891  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 
380 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186331  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2193  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.69 
 
 
374 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0616046  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3270  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.96 
 
 
379 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756074  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>