178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0077 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  100 
 
 		 150 aa  317  3.9999999999999996e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  51.72 
 
 		 332 aa  91.3  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3133  TonB-like protein  48.28 
 
 		 342 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3085  TonB-like protein  40 
 
 		 298 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.477938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  40.48 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  32.23 
 
 		 582 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0560  TonB-like protein  28.95 
 
 		 352 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000337767  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3214  TonB-like protein  33.33 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  32.89 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0810  TonB-like protein  39.39 
 
 		 614 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  34.67 
 
 		 258 aa  57.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  35 
 
 		 276 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  29.25 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  37.97 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  36.71 
 
 		 273 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  37.18 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  36.71 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  37.97 
 
 		 274 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00633  periplasmic protein TonB  39.53 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  32.69 
 
 		 244 aa  53.9  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  32.69 
 
 		 244 aa  53.9  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  35.44 
 
 		 248 aa  53.9  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  30.67 
 
 		 447 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  35.14 
 
 		 221 aa  51.6  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001860  ferric siderophore transport system binding protein TonB  38.82 
 
 		 210 aa  51.6  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  29.87 
 
 		 215 aa  51.2  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  34.18 
 
 		 203 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  36.71 
 
 		 287 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  36.62 
 
 		 668 aa  50.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  30.77 
 
 		 237 aa  50.4  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  27.05 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  36.25 
 
 		 228 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  32.91 
 
 		 266 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  32.91 
 
 		 266 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  31.65 
 
 		 273 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  37.97 
 
 		 208 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  36.36 
 
 		 221 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  32.05 
 
 		 212 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  30 
 
 		 484 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  37.97 
 
 		 212 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  29.87 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  36.36 
 
 		 221 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  32.91 
 
 		 308 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  35.44 
 
 		 288 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  31.91 
 
 		 367 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  28 
 
 		 368 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  35.44 
 
 		 206 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  30 
 
 		 270 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  28.95 
 
 		 269 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  26.92 
 
 		 249 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  31.17 
 
 		 228 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  29.33 
 
 		 604 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  30 
 
 		 264 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  35.44 
 
 		 237 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  34.18 
 
 		 207 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  25.32 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  29.11 
 
 		 207 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  31.65 
 
 		 202 aa  47.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  34.18 
 
 		 206 aa  47.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  32.91 
 
 		 206 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  33.75 
 
 		 280 aa  47  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  32.91 
 
 		 206 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  27.27 
 
 		 245 aa  47  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  32.91 
 
 		 206 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  32.5 
 
 		 233 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  32.91 
 
 		 206 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4100  TonB family protein  31.71 
 
 		 234 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.694264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  28.46 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  32.91 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  29.49 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  32.91 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  35 
 
 		 371 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  30 
 
 		 286 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  33.75 
 
 		 232 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  35.71 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  31.18 
 
 		 239 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  31.18 
 
 		 244 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  30 
 
 		 275 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  35 
 
 		 371 aa  45.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  35.44 
 
 		 207 aa  45.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  32.91 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  31.18 
 
 		 239 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  32.05 
 
 		 244 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  29.41 
 
 		 302 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  31.18 
 
 		 239 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  30 
 
 		 274 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  31.18 
 
 		 239 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  31.18 
 
 		 239 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  30.99 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  31.18 
 
 		 244 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  31.18 
 
 		 243 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  32.91 
 
 		 207 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4405  TonB-like protein  32.26 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  31.18 
 
 		 239 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  26.92 
 
 		 277 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  36.49 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  28 
 
 		 238 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  26.19 
 
 		 565 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  28.57 
 
 		 285 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  33.75 
 
 		 244 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>