More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0071 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0071  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  621  1e-177  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.677177  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  35.57 
 
 
296 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  38.19 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.25 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  38.71 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  31.85 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  39.44 
 
 
144 aa  82  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  29.62 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  34.06 
 
 
147 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  37.14 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  35.81 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  29.2 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  28.78 
 
 
288 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  36.17 
 
 
152 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  30.6 
 
 
281 aa  75.5  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  29.61 
 
 
149 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  35.51 
 
 
142 aa  74.3  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  35 
 
 
145 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  39.04 
 
 
162 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  38.73 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  27.94 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  26.5 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  22.04 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  32.85 
 
 
143 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  28.71 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  32.37 
 
 
147 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  39.19 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  33.99 
 
 
145 aa  70.9  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  35.62 
 
 
148 aa  70.5  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  35.51 
 
 
154 aa  70.5  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
151 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  32.03 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  32.37 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  24.19 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  30.61 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  31.03 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  32.68 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  35.92 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  35.86 
 
 
153 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  35.66 
 
 
173 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  35.86 
 
 
153 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  36.84 
 
 
151 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  32.34 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  29.29 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  26.35 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  22.85 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  34.46 
 
 
153 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  32.68 
 
 
145 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  31.21 
 
 
148 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  33.77 
 
 
158 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  30.07 
 
 
151 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  28.87 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  30.32 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
156 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  29.58 
 
 
151 aa  67  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  24.16 
 
 
294 aa  67  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  35.17 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  32.85 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  35.37 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  35.37 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  31.39 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  34.69 
 
 
170 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
162 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  34.69 
 
 
170 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  32.57 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  30.5 
 
 
149 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  33.78 
 
 
156 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  35.62 
 
 
162 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  29.8 
 
 
154 aa  65.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  27.47 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  31.21 
 
 
157 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  28.16 
 
 
291 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  35.66 
 
 
158 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
147 aa  64.3  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  34.93 
 
 
151 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  34.78 
 
 
283 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  35.62 
 
 
162 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  35.17 
 
 
155 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  28.62 
 
 
295 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  30.97 
 
 
212 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  35.66 
 
 
148 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  32.37 
 
 
307 aa  64.3  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  30.61 
 
 
288 aa  63.5  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 
147 aa  63.5  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  26.24 
 
 
325 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  33.33 
 
 
187 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  40.91 
 
 
293 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1652  UspA domain protein  31.09 
 
 
270 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.432641  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  40.91 
 
 
293 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 
143 aa  63.5  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
156 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  35.37 
 
 
169 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
162 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  56.86 
 
 
163 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
143 aa  63.2  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
147 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>