More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0047 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  100 
 
 		 849 aa  1750    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  40.99 
 
 		 744 aa  571  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.28 
 
 		 741 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.45 
 
 		 759 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  40.35 
 
 		 731 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  39.93 
 
 		 732 aa  536  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.09 
 
 		 757 aa  533  1e-150  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  39.81 
 
 		 768 aa  526  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  39.07 
 
 		 779 aa  523  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.08 
 
 		 755 aa  522  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.18 
 
 		 772 aa  522  1e-146  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  39.07 
 
 		 736 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0382  UvrD/REP helicase  39.4 
 
 		 812 aa  517  1.0000000000000001e-145  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.264262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.75 
 
 		 786 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.67 
 
 		 725 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.3 
 
 		 831 aa  505  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.3 
 
 		 758 aa  505  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  37.31 
 
 		 762 aa  500  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.53 
 
 		 817 aa  499  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0950  UvrD/REP helicase  39.44 
 
 		 813 aa  501  1e-140  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000846771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.15 
 
 		 781 aa  501  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  37.11 
 
 		 757 aa  498  1e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1339  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.33 
 
 		 828 aa  496  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574982  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  36.8 
 
 		 757 aa  495  9.999999999999999e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2024  ATP-dependent DNA helicase Rep  35.83 
 
 		 814 aa  493  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.260389  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.17 
 
 		 829 aa  495  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.07 
 
 		 802 aa  492  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.53 
 
 		 795 aa  490  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  41.32 
 
 		 678 aa  490  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.38 
 
 		 694 aa  489  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.01 
 
 		 762 aa  489  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.69 
 
 		 806 aa  492  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  41.09 
 
 		 678 aa  491  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  40.25 
 
 		 678 aa  487  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.31 
 
 		 851 aa  488  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.17 
 
 		 794 aa  488  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.54 
 
 		 797 aa  489  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  36.36 
 
 		 721 aa  483  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1258  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.02 
 
 		 864 aa  485  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.887597  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.33 
 
 		 765 aa  485  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4330  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.18 
 
 		 785 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.82343  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  36.34 
 
 		 727 aa  485  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4416  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.18 
 
 		 785 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464468  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  36.25 
 
 		 721 aa  480  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.79 
 
 		 838 aa  479  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.64 
 
 		 857 aa  480  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4873  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.7 
 
 		 775 aa  482  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4710  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.74 
 
 		 784 aa  479  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  39.6 
 
 		 746 aa  478  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  37.24 
 
 		 771 aa  477  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  35.46 
 
 		 722 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  35.46 
 
 		 722 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  35.46 
 
 		 722 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.08 
 
 		 858 aa  474  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  35.46 
 
 		 722 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1861  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.41 
 
 		 780 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.95 
 
 		 797 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  37.39 
 
 		 797 aa  472  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2777  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.23 
 
 		 817 aa  471  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46822  normal  0.929226 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.96 
 
 		 781 aa  472  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  36.4 
 
 		 720 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  36.4 
 
 		 720 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  36.4 
 
 		 720 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  36.4 
 
 		 720 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  36.4 
 
 		 720 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.4 
 
 		 729 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  41.47 
 
 		 797 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  35.97 
 
 		 741 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4844  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.24 
 
 		 776 aa  461  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  35.81 
 
 		 773 aa  456  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  41.03 
 
 		 721 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  41.2 
 
 		 797 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  36.31 
 
 		 724 aa  457  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  36.6 
 
 		 735 aa  457  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  38.13 
 
 		 726 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  35.66 
 
 		 758 aa  458  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  35.61 
 
 		 724 aa  456  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  49.17 
 
 		 785 aa  456  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  49.58 
 
 		 751 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  36.09 
 
 		 789 aa  449  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  36.93 
 
 		 721 aa  452  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  48.95 
 
 		 742 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  36.3 
 
 		 892 aa  449  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  49.37 
 
 		 751 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  35.25 
 
 		 723 aa  449  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  35.6 
 
 		 778 aa  448  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  36.63 
 
 		 755 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  35.14 
 
 		 723 aa  444  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.56 
 
 		 858 aa  444  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  48.2 
 
 		 732 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  34.43 
 
 		 722 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  48.02 
 
 		 741 aa  443  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  47.79 
 
 		 715 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  48.41 
 
 		 711 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  35.27 
 
 		 783 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  36.08 
 
 		 840 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  35.9 
 
 		 790 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  34.32 
 
 		 726 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2822  UvrD/REP helicase  34.26 
 
 		 826 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.467404 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  34.92 
 
 		 783 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>