55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0038 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0038  TonB-like protein  100 
 
 
362 aa  748    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  35.24 
 
 
244 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  41.46 
 
 
799 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  35.43 
 
 
1507 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1716  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 
162 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.37 
 
 
771 aa  57.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  32.18 
 
 
1328 aa  56.6  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 
481 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  39.24 
 
 
669 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  32.38 
 
 
255 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 
1215 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.91 
 
 
885 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  30 
 
 
1044 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  27.2 
 
 
680 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  29.73 
 
 
977 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  26 
 
 
672 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 
843 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  37.84 
 
 
725 aa  53.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 
911 aa  52.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 
919 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 
924 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2113  TonB-like protein  55.81 
 
 
235 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675325  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.5 
 
 
1424 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  26.44 
 
 
825 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  32.91 
 
 
822 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 
751 aa  50.1  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  40.79 
 
 
190 aa  49.7  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  31.25 
 
 
212 aa  49.7  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  29.27 
 
 
362 aa  49.7  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.53 
 
 
568 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
568 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  30.25 
 
 
582 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.86 
 
 
767 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2101  TonB-like protein  45.28 
 
 
487 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47465  predicted protein  34.02 
 
 
731 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
785 aa  47.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  27.68 
 
 
782 aa  47  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.71 
 
 
609 aa  46.2  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4364  hypothetical protein  28.26 
 
 
247 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  26.09 
 
 
1039 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.34 
 
 
1186 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3657  hypothetical protein  38.71 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 
787 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  28.57 
 
 
237 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.33 
 
 
854 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 
454 aa  44.3  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  38.89 
 
 
253 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 
443 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23.68 
 
 
2145 aa  43.9  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.93 
 
 
968 aa  43.9  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  32.47 
 
 
311 aa  43.5  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  28.36 
 
 
2413 aa  43.5  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  38.1 
 
 
371 aa  43.1  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
1105 aa  43.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  29.13 
 
 
1131 aa  42.7  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>