186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0034 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  100 
 
 
99 aa  196  7e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  48.24 
 
 
97 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  55.74 
 
 
82 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3272  regulatory protein, FmdB family  41.67 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.248123  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3101  regulatory protein, FmdB family  46.34 
 
 
83 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0427  FmdB family regulatory protein  36.36 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.953461  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1038  FmdB family regulatory protein  45.56 
 
 
90 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000617496  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0509  regulatory protein, FmdB family  50.79 
 
 
73 aa  77  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000024131  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  44.44 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  44.44 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  56.14 
 
 
83 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03040  putative regulatory protein, FmdB family  52.46 
 
 
71 aa  75.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  53.23 
 
 
95 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1467  regulatory protein, FmdB family  42.68 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0863  hypothetical protein  52.24 
 
 
83 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0488  regulatory protein, FmdB family  51.79 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.813132  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0548  FmdB family regulatory protein  43.3 
 
 
88 aa  73.6  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145953  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2539  hypothetical protein  48.65 
 
 
85 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.36204e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  53.45 
 
 
88 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  42.71 
 
 
94 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3106  FmdB family regulatory protein  48.21 
 
 
108 aa  72  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000220195  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1324  FmdB family regulatory protein  39.29 
 
 
114 aa  72  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00811436 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1172  regulatory protein, FmdB family  43.62 
 
 
87 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.884251  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0219  regulatory protein, FmdB family  46.25 
 
 
91 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530805  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0208  regulatory protein, FmdB family  46.25 
 
 
91 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3821  FmdB family regulatory protein  41.38 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268528  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2782  FmdB family regulatory protein  51.72 
 
 
63 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155022  normal  0.0575706 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0196  hypothetical protein  43.21 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0161  FmdB family regulatory protein  46.88 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.740481  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0108  regulatory protein, FmdB family  48.21 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0629373  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1830  regulatory protein, FmdB family  47.06 
 
 
83 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0742  FmdB family regulatory protein  42.86 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.105899  normal  0.441026 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11009  serine rich protein  46.43 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.667745 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  53.45 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3010  hypothetical protein  41.67 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.794189  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2465  regulatory protein, FmdB family  44.93 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0532528  hitchhiker  0.00128388 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0232  regulatory protein, FmdB family  50.88 
 
 
58 aa  67.8  0.00000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0094  regulatory protein, FmdB family  47.62 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4089  regulatory protein, FmdB family  44.07 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5267  regulatory protein, FmdB family  39 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  67  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  38.71 
 
 
85 aa  67  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1114  regulatory protein, FmdB family  45.61 
 
 
74 aa  66.6  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00330778  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0558  hypothetical protein  43.21 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  48.28 
 
 
99 aa  66.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1727  regulatory protein, FmdB family  39.29 
 
 
85 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0359754  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0908  regulatory protein, FmdB family  50.91 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2661  hypothetical protein  49.12 
 
 
82 aa  65.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0464  hypothetical protein  41.56 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0213  FmdB family regulatory protein  43.33 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.119501 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  42.7 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8652  putative regulatory protein, FmdB family  46.43 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0626  regulatory protein, FmdB family  48.21 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4645  regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  42.31 
 
 
78 aa  65.5  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0787  FmdB family regulatory protein  46.43 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0785  FmdB family regulatory protein  46.55 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0371  hypothetical protein  46.43 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0376  hypothetical protein  44.62 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4292  FmdB transcriptional regulator  44.64 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4378  FmdB family regulatory protein  44.64 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  0.589955 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3639  FmdB family regulatory protein  46.55 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0654  regulatory protein, FmdB family  35.96 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257627  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3034  FmdB family regulatory protein  48.28 
 
 
84 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773747  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4124  regulatory protein, FmdB family  44.12 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  44.12 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4670  FmdB family regulatory protein  44.64 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0329006  normal  0.590525 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2140  FmdB family regulatory protein  48.28 
 
 
99 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.0886847 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0850  regulatory protein  39.76 
 
 
113 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4003  FmdB family regulatory protein  44.12 
 
 
73 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2117  hypothetical protein  37.25 
 
 
101 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.145688  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1745  FmdB family regulatory protein  45.9 
 
 
91 aa  62.8  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.195874  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3191  FmdB family regulatory protein  47.17 
 
 
91 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0428  hypothetical protein  45.9 
 
 
91 aa  62.8  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.575896  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1212  hypothetical protein  44.12 
 
 
73 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4206  FmdB family regulatory protein  44.12 
 
 
73 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384212  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2115  FmdB transcriptional regulator  44.62 
 
 
117 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2727  FmdB family regulatory protein  44.62 
 
 
117 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0305194  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0379  FmdB family regulatory protein  39.29 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42078 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13090  putative regulatory protein, FmdB family  34.91 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0657763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2754  FmdB family regulatory protein  44.62 
 
 
117 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0326543  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2754  hypothetical protein  44.29 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.82151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2324  hypothetical protein  44.29 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0673  hypothetical protein  39.76 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0689  hypothetical protein  44.29 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2404  hypothetical protein  44.29 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0801  regulatory protein, FmdB family  42.62 
 
 
90 aa  62  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1241  FmdB family regulatory protein  44.12 
 
 
73 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292209  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4011  FmdB family regulatory protein  46.55 
 
 
108 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000161768 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  44.12 
 
 
73 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01549  putative regulatory protein, FmdB family  35.53 
 
 
97 aa  62  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0872  FmdB family regulatory protein  42.62 
 
 
105 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.616078  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1068  hypothetical protein  44.83 
 
 
128 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6054  hypothetical protein  43.75 
 
 
115 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5455  FmdB family regulatory protein  43.1 
 
 
105 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2720  regulatory protein, FmdB family  56.25 
 
 
82 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0437  hypothetical protein  45.76 
 
 
157 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1496  regulatory protein, FmdB family  56.25 
 
 
82 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000164684  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2778  FmdB family regulatory protein  43.75 
 
 
111 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2645  FmdB family regulatory protein  43.75 
 
 
111 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.596631  normal  0.169906 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>