22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0011 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0011  hypothetical protein  100 
 
 
493 aa  1024    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3318  hypothetical protein  35.76 
 
 
467 aa  286  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0138  hypothetical protein  36.13 
 
 
469 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000720067  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1929  hypothetical protein  33.61 
 
 
510 aa  256  8e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.696713  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2788  hypothetical protein  32.84 
 
 
484 aa  251  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1514  hypothetical protein  32.13 
 
 
476 aa  248  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.721483  normal  0.922529 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3680  hypothetical protein  31.21 
 
 
506 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2733  hypothetical protein  28.33 
 
 
478 aa  207  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1763  hypothetical protein  31.16 
 
 
501 aa  201  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0973  hypothetical protein  28.39 
 
 
485 aa  193  5e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.442051  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1912  hypothetical protein  27.39 
 
 
484 aa  189  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398652  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2711  hypothetical protein  28.63 
 
 
474 aa  170  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0676  hypothetical protein  27.92 
 
 
454 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2690  hypothetical protein  30.23 
 
 
498 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2583  hypothetical protein  27.19 
 
 
463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0198931 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0471  hypothetical protein  20.5 
 
 
373 aa  76.6  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1062  hypothetical protein  21.43 
 
 
460 aa  69.7  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0677  hypothetical protein  24.91 
 
 
524 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.823751 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1372  hypothetical protein  23.19 
 
 
407 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.856108  normal  0.0265653 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2689  hypothetical protein  22.25 
 
 
506 aa  60.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2710  hypothetical protein  24.43 
 
 
519 aa  52.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1148  hypothetical protein  24.29 
 
 
408 aa  48.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.159501 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>