More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0008 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03582  DNA gyrase subunit B  47.09 
 
 		 804 aa  722    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0004  DNA gyrase, B subunit  47.09 
 
 		 804 aa  722    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0004  DNA gyrase subunit B  46.62 
 
 		 806 aa  698    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3220  DNA gyrase subunit B  46.07 
 
 		 811 aa  691    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  52.3 
 
 		 795 aa  824    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0013  DNA gyrase subunit B  46.9 
 
 		 806 aa  706    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.571026  unclonable  0.0000003087 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  55.08 
 
 		 654 aa  639    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1224  DNA gyrase, B subunit  49.88 
 
 		 807 aa  769    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.060887  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4119  DNA gyrase, B subunit  45.7 
 
 		 874 aa  667    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0784571  normal  0.168166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0004  DNA gyrase subunit B  47.56 
 
 		 806 aa  706    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3440  DNA gyrase subunit B  45.82 
 
 		 842 aa  704    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.683175  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0015  DNA gyrase subunit B  46.27 
 
 		 811 aa  688    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0004  DNA gyrase, B subunit  46.53 
 
 		 814 aa  717    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2886  DNA gyrase, B subunit  45.35 
 
 		 812 aa  660    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0125  DNA gyrase subunit B  45.24 
 
 		 810 aa  682    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0011  DNA gyrase, B subunit  46.14 
 
 		 805 aa  716    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0004  DNA gyrase, subunit B  46.27 
 
 		 805 aa  700    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0008  DNA gyrase subunit B  44.53 
 
 		 812 aa  646    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2235  DNA gyrase subunit B  44.39 
 
 		 822 aa  687    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0003  DNA gyrase subunit B  44.39 
 
 		 822 aa  687    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0003  DNA gyrase subunit B  44.39 
 
 		 822 aa  687    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0925325  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0121  DNA gyrase subunit B  45.38 
 
 		 810 aa  681    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.853058  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2802  DNA gyrase subunit B  46.22 
 
 		 826 aa  696    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0885593 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0004  DNA gyrase subunit B  46.27 
 
 		 805 aa  700    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0006  DNA gyrase subunit B  46.5 
 
 		 811 aa  690    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311968 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0003  DNA gyrase subunit B  45.29 
 
 		 834 aa  676    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0123108  hitchhiker  0.00974324 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0003  DNA gyrase subunit B  45.31 
 
 		 841 aa  684    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150441  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  57.09 
 
 		 633 aa  639    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0003  DNA gyrase subunit B  45.25 
 
 		 823 aa  689    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0003  DNA gyrase, B subunit  44.05 
 
 		 868 aa  681    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0299  DNA gyrase subunit B  44.39 
 
 		 822 aa  687    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.281677  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0019  DNA gyrase, B subunit  47.31 
 
 		 807 aa  715    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0004  DNA gyrase subunit B  46.09 
 
 		 805 aa  695    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000624139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1346  DNA gyrase subunit B  46.27 
 
 		 811 aa  688    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  51.06 
 
 		 795 aa  801    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3184  DNA gyrase subunit B  45.24 
 
 		 824 aa  692    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.505435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0004  DNA gyrase, B subunit  46.14 
 
 		 805 aa  712    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195183  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0003  DNA gyrase, B subunit  44.56 
 
 		 832 aa  679    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  51.29 
 
 		 795 aa  813    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0003  DNA gyrase subunit B  44.84 
 
 		 797 aa  639    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0012  DNA gyrase, B subunit  44.68 
 
 		 813 aa  677    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00964713  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0003  DNA gyrase subunit B  45.44 
 
 		 851 aa  684    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0003  DNA gyrase subunit B  48.13 
 
 		 810 aa  725    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.835475  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0004  DNA gyrase subunit B  46.8 
 
 		 802 aa  685    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  54.81 
 
 		 634 aa  635    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3241  DNA gyrase subunit B  44.62 
 
 		 822 aa  694    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0004  DNA gyrase subunit B  50 
 
 		 795 aa  744    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0005  DNA gyrase subunit B  45.67 
 
 		 813 aa  659    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3310  DNA gyrase subunit B  45.13 
 
 		 835 aa  664    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2504  DNA gyrase subunit B  47.68 
 
 		 805 aa  731    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.892795  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0004  DNA gyrase subunit B  46.5 
 
 		 805 aa  683    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0003  DNA gyrase, B subunit  44.57 
 
 		 870 aa  676    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.41249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0004  DNA gyrase subunit B  46.98 
 
 		 808 aa  714    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00999238  normal  0.275353 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  58.87 
 
 		 638 aa  644    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0003  DNA gyrase subunit B  46.49 
 
 		 798 aa  720    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0221229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0003  DNA gyrase subunit B  44.74 
 
 		 874 aa  667    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0319468  normal  0.972723 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4460  DNA gyrase subunit B  44.91 
 
 		 823 aa  687    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318757  normal  0.407237 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0004  DNA gyrase, B subunit  45.78 
 
 		 805 aa  709    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.236407  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  56.23 
 
 		 632 aa  663    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0004  DNA gyrase subunit B  45.4 
 
 		 813 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0004  DNA gyrase subunit B  55.54 
 
 		 805 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  58.23 
 
 		 641 aa  640    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  60.03 
 
 		 794 aa  738    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0003  DNA gyrase subunit B  44.7 
 
 		 841 aa  672    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0131  DNA gyrase, B subunit  46.64 
 
 		 802 aa  700    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.155863  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0008  DNA gyrase subunit B  100 
 
 		 879 aa  1806    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.938168  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0007  DNA gyrase subunit B  45.94 
 
 		 805 aa  701    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.197226  normal  0.376081 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2972  DNA gyrase, B subunit  44.7 
 
 		 858 aa  656    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0506352 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2555  DNA gyrase subunit B  45.46 
 
 		 824 aa  694    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0004  DNA gyrase, B subunit  45.78 
 
 		 805 aa  709    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  57.44 
 
 		 644 aa  660    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0004  DNA gyrase, B subunit  46.95 
 
 		 806 aa  714    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0004  DNA gyrase subunit B  45.96 
 
 		 804 aa  703    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.083955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  56.37 
 
 		 652 aa  657    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0004  DNA gyrase subunit B  46.9 
 
 		 806 aa  706    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.045671  normal  0.178752 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0004  DNA gyrase, B subunit  46.67 
 
 		 807 aa  707    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0620606  hitchhiker  0.000000000288479 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1708  DNA gyrase subunit B  46.4 
 
 		 807 aa  694    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0004  DNA gyrase subunit B  46.03 
 
 		 805 aa  710    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.850847  unclonable  0.0000000000498396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0004  DNA gyrase subunit B  46.03 
 
 		 805 aa  710    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.666874  normal  0.0301328 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0004  DNA gyrase subunit B  48.26 
 
 		 805 aa  742    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477519 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0004  DNA gyrase, B subunit  46.65 
 
 		 805 aa  703    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0166192  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.02 
 
 		 633 aa  640    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2850  DNA gyrase subunit B  44.39 
 
 		 822 aa  687    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.60732  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0003  DNA gyrase subunit B  44.78 
 
 		 824 aa  690    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00050  DNA gyrase subunit B  47.45 
 
 		 806 aa  705    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1346  DNA gyrase subunit B  46.85 
 
 		 809 aa  707    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0003  DNA gyrase subunit B  45.46 
 
 		 824 aa  694    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  58.18 
 
 		 628 aa  678    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2689  DNA gyrase, B subunit  48.08 
 
 		 808 aa  751    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  decreased coverage  0.000240377 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0006  DNA gyrase subunit B  47.02 
 
 		 812 aa  708    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0012  DNA gyrase subunit B  46.03 
 
 		 805 aa  710    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000257607 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  50.94 
 
 		 802 aa  813    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0004  DNA gyrase, B subunit  46.61 
 
 		 805 aa  702    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279894  hitchhiker  0.0000731139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0016  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  46.83 
 
 		 805 aa  713    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.976365  hitchhiker  0.00112252 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0101  DNA gyrase subunit B  44.39 
 
 		 822 aa  687    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3717  DNA gyrase, B subunit  45.35 
 
 		 809 aa  677    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0087  DNA gyrase subunit B  44.39 
 
 		 822 aa  687    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0005  DNA gyrase subunit B  46.42 
 
 		 804 aa  705    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645478  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0005  DNA gyrase, B subunit  46.73 
 
 		 798 aa  702    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4146  DNA gyrase subunit B  45.32 
 
 		 868 aa  677    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.66151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>