237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0005 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  100 
 
 		 421 aa  836    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  61.45 
 
 		 419 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  54.85 
 
 		 420 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6584  major facilitator superfamily MFS_1  54.61 
 
 		 420 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  51.09 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2822  major facilitator superfamily MFS_1  51.72 
 
 		 415 aa  386  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2947  major facilitator superfamily MFS_1  47.13 
 
 		 432 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1434  major facilitator transporter  47.47 
 
 		 432 aa  322  6e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1407  major facilitator transporter  47.23 
 
 		 447 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1398  major facilitator transporter  47.23 
 
 		 432 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  28.81 
 
 		 426 aa  147  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  28.81 
 
 		 426 aa  146  6e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  28.18 
 
 		 423 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  28.18 
 
 		 423 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  28.18 
 
 		 423 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  28.18 
 
 		 423 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  28.18 
 
 		 423 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  28.99 
 
 		 435 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  29.13 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  31.47 
 
 		 424 aa  141  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  25.79 
 
 		 440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  29.93 
 
 		 423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  29.9 
 
 		 431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  29.15 
 
 		 423 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  29.18 
 
 		 423 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  29.01 
 
 		 415 aa  137  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  29.9 
 
 		 431 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  27.98 
 
 		 435 aa  136  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  27.91 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  29.66 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  30.75 
 
 		 415 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  29.33 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  30.53 
 
 		 421 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  29.9 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  27.59 
 
 		 436 aa  129  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  29.38 
 
 		 435 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  28.93 
 
 		 427 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  30.15 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  27.44 
 
 		 420 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1218  Fucose permease-like protein  63.96 
 
 		 158 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  27.62 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  27.37 
 
 		 407 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  28.57 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  26.93 
 
 		 412 aa  116  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  25.3 
 
 		 431 aa  116  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  25 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  27.13 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  26.36 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  25.77 
 
 		 425 aa  112  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  26.56 
 
 		 458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  26.68 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  26.86 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 406 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  26.57 
 
 		 428 aa  109  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  27.14 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  26.56 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  25.4 
 
 		 439 aa  107  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  24.63 
 
 		 417 aa  106  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  25 
 
 		 417 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  27.81 
 
 		 431 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  27.72 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  25.42 
 
 		 408 aa  103  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  26.45 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  24.7 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  26.7 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  26.7 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  26.7 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  27.66 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  26.7 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  26.67 
 
 		 406 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  26.45 
 
 		 438 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  25.68 
 
 		 437 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  27.66 
 
 		 413 aa  100  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  25.26 
 
 		 407 aa  97.4  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  24.11 
 
 		 438 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  24.11 
 
 		 438 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  24.11 
 
 		 438 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  24.11 
 
 		 438 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  24.11 
 
 		 438 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 406 aa  94.4  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  25.06 
 
 		 419 aa  93.6  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  27.42 
 
 		 429 aa  92.8  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  26.49 
 
 		 407 aa  92.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  23.94 
 
 		 436 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  24.57 
 
 		 431 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.36 
 
 		 438 aa  92  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  25.24 
 
 		 429 aa  91.3  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  25.49 
 
 		 429 aa  90.9  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  23.92 
 
 		 426 aa  90.5  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  25 
 
 		 405 aa  89.4  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.61 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  24.57 
 
 		 434 aa  87.8  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>