125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_R0049 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0246748  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000350278 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0026  tRNA-Leu  91.46 
 
 		 82 bp  107  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0022  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  95.6  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 85 bp  91.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0045  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 85 bp  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  normal  0.134818 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0049  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 82 bp  87.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.273052  hitchhiker  0.00863967 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10010  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 83 bp  85.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.592276  normal  0.477324 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0068  tRNA-Leu  89.23 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000622539  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0028  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0024  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31720  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1365  tRNA-Leu  88.46 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0010  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581648  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0028  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.639598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0050  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00562021  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0003  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.068778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380759  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0111  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R12  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0023  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34016  normal  0.730319 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.994542  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0445  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0460739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0014  tRNA-Leu  85.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20516  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00145069  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24950  tRNA-Leu  82.93 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.53191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.0000965884  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0007  tRNA-Leu  85.25 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0027  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000000908106  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0290157  normal  0.678466 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1681  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.602925  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259532  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0105  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651737  normal  0.103844 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309276  tRNA-Leu  85.25 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000019352  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14022  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0043  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17070  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.779723 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16310  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.352958  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t52  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329875  normal  0.0339044 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21120  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.387136  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0027  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.985368  normal  0.200865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0057  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811413  hitchhiker  0.000421816 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21100  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0065  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.401468  normal  0.0428865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0042  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0020  tRNA-Leu  84.72 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000445205  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000236208  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00820  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503548  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11760  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.764156  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0003  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0004  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.889028 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13650  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00181798  normal  0.743101 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  84.75 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  84.75 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0237  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000149567  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0003  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0003  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0020  tRNA-Leu  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24589  normal  0.0928681 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0003  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257366  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  84.75 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03630  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0612357  normal  0.0343105 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna084  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0619619  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0058  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0724128 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0022  tRNA-Leu  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0003  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190656 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4585  tRNA-Leu  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0003  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0022  tRNA-Leu  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0002  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00250  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t019  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0055  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.796576  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0027  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000026445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0031  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000037634  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0033  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505134  normal  0.14321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0039  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000435375  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0032  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000103773  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1759  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0100  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000931181  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0104  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000390142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0115  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122421  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0119  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110809  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2038  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000144559  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0764  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.509381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>