152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_R0003 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190656 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0003  tRNA-Leu  97.59 
 
 		 83 bp  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00250  tRNA-Leu  93.67 
 
 		 83 bp  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.427381  normal  0.701235 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0004  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 83 bp  107  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.889028 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00820  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  103  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503548  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0003  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 86 bp  91.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0003  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 83 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0003  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 83 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.012184 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0003  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 83 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0003  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 83 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.98053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0002  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 83 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.867688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14003  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 86 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0003  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 86 bp  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.589576  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0036  tRNA-Leu  90.41 
 
 		 83 bp  89.7  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000019352  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0003  tRNA-Leu  88.46 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48253  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0034  tRNA-Leu  89.86 
 
 		 83 bp  81.8  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0003  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 87 bp  79.8  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0002  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 84 bp  79.8  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0003  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 84 bp  79.8  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0003  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 84 bp  79.8  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257366  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0003  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 84 bp  79.8  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17070  tRNA-Leu  88.46 
 
 		 88 bp  77.8  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.779723 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0003  tRNA-Leu  87.18 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0039  tRNA-Leu  88.57 
 
 		 83 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0545231  normal  0.269092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0035  tRNA-Leu  89.19 
 
 		 84 bp  75.8  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0037  tRNA-Leu  89.19 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0003  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 83 bp  75.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21100  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 83 bp  73.8  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21120  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 83 bp  73.8  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.387136  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0031  tRNA-Leu  88.31 
 
 		 84 bp  73.8  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0989322 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00250  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0003  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0112279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0003  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0028  tRNA-Leu  86.05 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.639598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0040  tRNA-Leu  86.67 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0360515  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0038  tRNA-Leu  86.67 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000434442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0003  tRNA-Leu  85.9 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207592  hitchhiker  0.00400711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0027  tRNA-Leu  86.08 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.994542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0024  tRNA-Leu  86.08 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0029  tRNA-Leu  86.08 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0024  tRNA-Leu  86.08 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0036  tRNA-Leu  86.08 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14022  tRNA-Leu  86.08 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0040  tRNA-Leu  86.08 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00145069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0056  tRNA-Leu  86.3 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.177317  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0035  tRNA-Leu  89.06 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0033  tRNA-Leu  86.67 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34016  normal  0.730319 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0037  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0612357  normal  0.0343105 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0003  tRNA-Leu  86.11 
 
 		 83 bp  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0036  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0619619  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0003  tRNA-Leu  86.11 
 
 		 83 bp  63.9  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0013  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0033  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.544414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13650  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00181798  normal  0.743101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0069  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 83 bp  60  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.649401 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0045  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 89 bp  60  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259532  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0003  tRNA-Leu  85.14 
 
 		 83 bp  60  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0073  tRNA-Leu  85.14 
 
 		 83 bp  60  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357526  normal  0.875145 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11760  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.764156  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0030  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0290157  normal  0.678466 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0028  tRNA-Leu  85.33 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380759  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0025  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.873101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0055  tRNA-Leu  85.29 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0868413 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16310  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.352958  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0003    100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00430  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.366056  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0012  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.145187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0007  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.426461  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA2  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.839683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00084  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0537561  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0081  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0105  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.72191e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0026  tRNA-Leu  84.52 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  84.52 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000679583  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0095  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000279268  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4712  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.855369999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4727  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000238011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4729  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000255517  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5089  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000441658  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5113  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164855  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5115  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149408  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0029  tRNA-Leu  84.21 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000498774  normal  0.0770032 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4262  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000100431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4961  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000179002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4963  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000169309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4808  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000052486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4159  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000704733  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4874  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000096251  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4876  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000008654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4321  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000341532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4967  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000670615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4969  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000625029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5232  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000856484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5234  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000900844  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>