More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4621 on replicon NC_011881
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
413 aa  843    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  37.56 
 
 
406 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  31.12 
 
 
427 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  31.87 
 
 
420 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  28.68 
 
 
416 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  30.87 
 
 
420 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  28.36 
 
 
443 aa  126  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  30.31 
 
 
416 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 
414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 
488 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 
488 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 
421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 
484 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000108946  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 
503 aa  107  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  24.2 
 
 
420 aa  106  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  28.11 
 
 
454 aa  106  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 
421 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  27.89 
 
 
408 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 
422 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  25.18 
 
 
426 aa  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  22.77 
 
 
442 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 
417 aa  103  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 
410 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.29 
 
 
426 aa  102  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 
424 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 
410 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26 
 
 
431 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 
417 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 
410 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 
435 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 
430 aa  97.1  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5213  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 
415 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.506772 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  27.19 
 
 
411 aa  94.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  29.18 
 
 
414 aa  94.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 
412 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 
413 aa  94  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2313  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 
901 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708196  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 
450 aa  94  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.9 
 
 
403 aa  93.6  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 
429 aa  93.2  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  31.41 
 
 
425 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 
479 aa  90.1  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  30.26 
 
 
418 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  28.33 
 
 
504 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 
445 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2315  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 
925 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  26.35 
 
 
439 aa  89  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  26.47 
 
 
408 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 
460 aa  87.8  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 
412 aa  87  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  30.09 
 
 
439 aa  86.7  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 
403 aa  85.9  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 
427 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 
434 aa  85.5  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5476  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 
415 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.487316 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 
446 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.04 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  28.47 
 
 
445 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 
433 aa  84.3  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 
411 aa  84  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  23.51 
 
 
434 aa  83.6  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 
412 aa  82.8  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  32.99 
 
 
447 aa  83.2  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 
441 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 
433 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  29.66 
 
 
510 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 
406 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
411 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 
449 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  30.59 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  30.04 
 
 
442 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.26 
 
 
426 aa  79.7  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  28.95 
 
 
429 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3152  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 
970 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 
434 aa  78.2  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.66 
 
 
430 aa  77.8  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 
425 aa  77.4  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12341  periplasmic sugar-binding lipoprotein uspC  23.87 
 
 
440 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01900  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.94 
 
 
442 aa  77  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.867357  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  27.48 
 
 
432 aa  77  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 
419 aa  77  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1686  extracellular solute-binding protein family 1  23.2 
 
 
493 aa  77  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  24.94 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  24.94 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 
444 aa  76.6  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 
430 aa  76.6  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 
416 aa  76.6  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  24 
 
 
443 aa  76.3  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
415 aa  76.3  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0361  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 
444 aa  76.3  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 
446 aa  76.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1895  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 
445 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854658  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.47 
 
 
407 aa  76.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 
433 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 
412 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>