More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4598 on replicon NC_011881
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  100 
 
 		 188 aa  374  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  92.55 
 
 		 188 aa  353  6.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  76.5 
 
 		 186 aa  284  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  76.5 
 
 		 186 aa  284  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  76.5 
 
 		 186 aa  284  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  75.96 
 
 		 186 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  75.41 
 
 		 186 aa  283  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  76.5 
 
 		 186 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  74.32 
 
 		 186 aa  280  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  73.77 
 
 		 186 aa  278  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  73.77 
 
 		 186 aa  278  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  73.91 
 
 		 205 aa  277  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  74.86 
 
 		 201 aa  276  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  74.86 
 
 		 201 aa  276  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  73.37 
 
 		 185 aa  275  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  73.37 
 
 		 185 aa  275  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  73.37 
 
 		 185 aa  275  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  73.37 
 
 		 185 aa  275  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  72.28 
 
 		 185 aa  273  7e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  72.83 
 
 		 185 aa  273  9e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  72.68 
 
 		 186 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  72.68 
 
 		 186 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  69.02 
 
 		 184 aa  265  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  66.85 
 
 		 192 aa  258  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  67.03 
 
 		 235 aa  248  5e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  69.27 
 
 		 189 aa  246  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  61.75 
 
 		 188 aa  238  4e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  63.74 
 
 		 191 aa  238  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  57.75 
 
 		 188 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  67.48 
 
 		 183 aa  221  6e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  64.13 
 
 		 184 aa  218  6e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  62.16 
 
 		 187 aa  216  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  61.41 
 
 		 200 aa  214  8e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5336  transposon Tn21 resolvase  78.57 
 
 		 129 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  52.17 
 
 		 192 aa  191  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  51.1 
 
 		 187 aa  187  7e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  51.89 
 
 		 188 aa  174  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  51.35 
 
 		 188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  48.33 
 
 		 207 aa  157  8e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  44.07 
 
 		 183 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  41.4 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  39.36 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  38.92 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2319  resolvase, putative  46.56 
 
 		 137 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000512602  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  38.25 
 
 		 192 aa  123  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  39.27 
 
 		 205 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  39.27 
 
 		 205 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  38.59 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  38.59 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  41.94 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  43.68 
 
 		 186 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  39.33 
 
 		 184 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  36.61 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  40.96 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  38.2 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  39.44 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 		 188 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 		 188 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  41.49 
 
 		 194 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  38.1 
 
 		 188 aa  114  8.999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  39.23 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  38.89 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  37.78 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  37.7 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  38.38 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  38.89 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  38.42 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  38.42 
 
 		 196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  37.22 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  38.38 
 
 		 186 aa  111  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  42.11 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  34.41 
 
 		 188 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  36.17 
 
 		 205 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1647  resolvase domain protein  49.14 
 
 		 120 aa  110  9e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  35.59 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  36.96 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  34.41 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  36.22 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  37.44 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  37.44 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  37.44 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  34.41 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  38.59 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  37.97 
 
 		 191 aa  108  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  37.08 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  39.13 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  36.7 
 
 		 187 aa  108  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  40.64 
 
 		 188 aa  108  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  36.02 
 
 		 185 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  40 
 
 		 197 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  38.76 
 
 		 218 aa  107  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  36.67 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  42.57 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  39.13 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  33.51 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  39.57 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  40.44 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>