116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4575 on replicon NC_011881
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011881  Achl_4575  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 208 aa  420  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.838748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4256  regulatory protein TetR  29.7 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  49.09 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 250 aa  48.5  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  32.2 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 275 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 244 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 225 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0896  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00832617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 231 aa  45.4  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 245 aa  45.1  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 203 aa  45.1  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 194 aa  45.1  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 194 aa  45.1  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  43.75 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  29.44 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 424 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 275 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  31.15 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  35.78 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 263 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  32.88 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2217  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  41.67 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 446 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 270 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  41.67 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  28.57 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  28.57 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  28.57 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  40 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 239 aa  42.7  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  28.57 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  29.31 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  28.57 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 192 aa  42.4  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4635  regulatory protein, TetR  31.58 
 
 		 226 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  37.35 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  45.76 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  43.1 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  29.44 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  29.03 
 
 		 192 aa  42.4  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  28.57 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 194 aa  42  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 227 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 228 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 213 aa  42  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1678  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 216 aa  42  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 283 aa  42  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  30.43 
 
 		 227 aa  42  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 277 aa  42  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1790  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 251 aa  42  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2069  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 219 aa  42  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118237  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 278 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  41.6  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 243 aa  42  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 233 aa  42  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 278 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>