90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4540 on replicon NC_011881
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  34.69 
 
 		 1700 aa  748    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  35.03 
 
 		 1594 aa  646    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  37.48 
 
 		 1642 aa  831    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  33.26 
 
 		 1649 aa  689    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  32.67 
 
 		 2570 aa  689    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  36.16 
 
 		 1748 aa  780    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  45.92 
 
 		 1925 aa  1020    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  35.08 
 
 		 1702 aa  766    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  88.66 
 
 		 1575 aa  2868    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  35.46 
 
 		 1417 aa  671    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  34.69 
 
 		 1697 aa  741    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  33.14 
 
 		 1693 aa  747    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  100 
 
 		 1606 aa  3277    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  35.65 
 
 		 1516 aa  738    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  35.65 
 
 		 1703 aa  771    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  34.35 
 
 		 1726 aa  735    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  37.02 
 
 		 1956 aa  825    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  30.87 
 
 		 2098 aa  684    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  36.02 
 
 		 1669 aa  808    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  37.89 
 
 		 1669 aa  828    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  34.92 
 
 		 1701 aa  758    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  34.81 
 
 		 1697 aa  766    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  33.38 
 
 		 2077 aa  788    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  34.06 
 
 		 1706 aa  733    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  29.58 
 
 		 1932 aa  633  1e-179  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  29.56 
 
 		 1934 aa  621  1e-176  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  30.14 
 
 		 1722 aa  539  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  29.89 
 
 		 2274 aa  528  1e-148  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  33.1 
 
 		 1211 aa  514  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  29.83 
 
 		 1674 aa  499  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  26.02 
 
 		 2117 aa  489  1e-136  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  36.36 
 
 		 976 aa  462  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  33.84 
 
 		 2005 aa  427  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  31.25 
 
 		 761 aa  244  7.999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  33.66 
 
 		 763 aa  236  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  32.34 
 
 		 766 aa  202  5e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 577 aa  187  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  38.55 
 
 		 470 aa  178  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  34.48 
 
 		 526 aa  134  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0796  hypothetical protein  32.1 
 
 		 339 aa  121  7.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2349  hypothetical protein  27.46 
 
 		 341 aa  105  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0743518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1570  hypothetical protein  27.82 
 
 		 341 aa  104  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.447914  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  23.53 
 
 		 1379 aa  101  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  24.24 
 
 		 678 aa  98.2  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  43.1 
 
 		 284 aa  94.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  26.88 
 
 		 1328 aa  79.3  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  34.31 
 
 		 919 aa  60.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  37.36 
 
 		 572 aa  54.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3080  helicase related protein  31.34 
 
 		 1786 aa  53.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  25.41 
 
 		 254 aa  53.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0072  RecQ helicase, putative  28.8 
 
 		 468 aa  52.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  32.48 
 
 		 1170 aa  51.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  37.35 
 
 		 1116 aa  51.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  25.65 
 
 		 595 aa  50.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  24.89 
 
 		 971 aa  48.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  28.74 
 
 		 569 aa  48.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  27.82 
 
 		 903 aa  48.9  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  28.04 
 
 		 952 aa  48.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  28.89 
 
 		 872 aa  48.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  29.79 
 
 		 894 aa  48.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  27.15 
 
 		 1168 aa  48.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  27.7 
 
 		 466 aa  48.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  28.76 
 
 		 1065 aa  48.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  28.76 
 
 		 1065 aa  48.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  33.71 
 
 		 560 aa  48.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  23.51 
 
 		 1165 aa  47.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  33.33 
 
 		 560 aa  47.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  33.33 
 
 		 560 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  31.3 
 
 		 1046 aa  47.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  33.33 
 
 		 560 aa  47.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  33.33 
 
 		 560 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  33.33 
 
 		 560 aa  47.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 560 aa  47.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  30.94 
 
 		 1147 aa  47.8  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  33.33 
 
 		 560 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  26.62 
 
 		 958 aa  47.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  33.33 
 
 		 560 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  33.33 
 
 		 560 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  33.33 
 
 		 560 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  25.73 
 
 		 573 aa  47  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  28.83 
 
 		 969 aa  47  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  24.48 
 
 		 1449 aa  47  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  30.93 
 
 		 900 aa  46.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  35.9 
 
 		 584 aa  46.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  24.29 
 
 		 986 aa  46.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  35.53 
 
 		 922 aa  46.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  31.65 
 
 		 958 aa  45.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  30.86 
 
 		 968 aa  45.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  31.52 
 
 		 669 aa  45.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  38.71 
 
 		 541 aa  45.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>