More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4128 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  100 
 
 
231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  47.59 
 
 
197 aa  190  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  50 
 
 
195 aa  185  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  44.86 
 
 
195 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  45.6 
 
 
309 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  41.18 
 
 
307 aa  146  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  41.18 
 
 
307 aa  146  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  41.36 
 
 
192 aa  145  6e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  42.33 
 
 
182 aa  145  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  43.62 
 
 
201 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  41.05 
 
 
201 aa  143  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  41.97 
 
 
193 aa  143  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  42.25 
 
 
197 aa  142  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  43.39 
 
 
186 aa  141  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  41.18 
 
 
198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  42.16 
 
 
193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  40.5 
 
 
199 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  39.13 
 
 
209 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  42.47 
 
 
185 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  41.44 
 
 
191 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  41.44 
 
 
191 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  42.11 
 
 
188 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  42.47 
 
 
185 aa  136  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  43.3 
 
 
197 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  40.84 
 
 
187 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  42.7 
 
 
201 aa  135  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  40.76 
 
 
201 aa  135  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  40.61 
 
 
219 aa  135  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  41.36 
 
 
197 aa  135  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  41.36 
 
 
197 aa  135  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  42.49 
 
 
201 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  41.05 
 
 
188 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  40.32 
 
 
188 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  41.94 
 
 
185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  41.4 
 
 
191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  41.27 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  41.4 
 
 
185 aa  133  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  41.4 
 
 
185 aa  133  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  39.15 
 
 
199 aa  133  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  39.15 
 
 
193 aa  133  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  36.7 
 
 
181 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  39.9 
 
 
188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  38.17 
 
 
183 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  38.17 
 
 
183 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  38.62 
 
 
201 aa  132  6e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  41.36 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  41.36 
 
 
198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  42.33 
 
 
203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  40.32 
 
 
185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  41.49 
 
 
189 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  40.32 
 
 
185 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  41.61 
 
 
176 aa  129  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  41.49 
 
 
189 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  40.2 
 
 
204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  40.2 
 
 
204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  43.09 
 
 
194 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  43.68 
 
 
184 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  37.68 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0219  DNA-invertase hin  43.16 
 
 
184 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0242276 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  36.13 
 
 
184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  41.18 
 
 
196 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  39.15 
 
 
183 aa  125  7e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  39.79 
 
 
189 aa  124  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  41.62 
 
 
210 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  38.81 
 
 
194 aa  123  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  36.51 
 
 
181 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  37.77 
 
 
180 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  43.39 
 
 
190 aa  122  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  35.83 
 
 
180 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  39.09 
 
 
204 aa  121  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  39.09 
 
 
204 aa  121  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  39.09 
 
 
204 aa  121  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  38.38 
 
 
218 aa  121  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  40.1 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  39.47 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  40.1 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  43.42 
 
 
188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  38.3 
 
 
196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  38.04 
 
 
187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  39.25 
 
 
193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  38.04 
 
 
190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  39.06 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  38.04 
 
 
188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  39.09 
 
 
204 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  36.36 
 
 
198 aa  119  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  39.67 
 
 
197 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  38.92 
 
 
192 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  38.92 
 
 
192 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  39.59 
 
 
215 aa  119  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  38.38 
 
 
192 aa  118  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  38.14 
 
 
190 aa  118  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  38.14 
 
 
190 aa  118  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  38.14 
 
 
190 aa  118  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  34.92 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  37.57 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  39.46 
 
 
191 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  38.62 
 
 
191 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  39.06 
 
 
228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  40.11 
 
 
193 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2284  Resolvase domain protein  39.36 
 
 
190 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>