216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4078 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011879  Achl_4078  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4454  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.27 
 
 		 187 aa  112  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000618173 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2310  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.91 
 
 		 336 aa  112  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167854 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1982  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.59 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1948  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  35.59 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.111386  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3096  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.05 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.316534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2578  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  33.7 
 
 		 337 aa  102  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0358543  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1688  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.29 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.609877 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1432  exonuclease  33.54 
 
 		 184 aa  91.7  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0902  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.48 
 
 		 210 aa  91.7  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0492  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.57 
 
 		 189 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.6637  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08390  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  36.6 
 
 		 381 aa  89.7  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.69329  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1655  DNA polymerase III subunit epsilon  29.71 
 
 		 302 aa  89.4  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2129  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.79 
 
 		 335 aa  89  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1394  DNA polymerase III subunit epsilon  29.14 
 
 		 302 aa  89  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00500752  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0010  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.69 
 
 		 289 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.847041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1582  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.73 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0402  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  28.92 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000167602  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2865  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3-5 exonuclease  30.64 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161368  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0009  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.22 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0223  exonuclease  30.61 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3293  exonuclease  29.61 
 
 		 314 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.413977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2577  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.47 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.181188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1529  DNA polymerase III, epsilon subunit related 3'-5' exonuclease  28.49 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0370  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.35 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2838  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.57 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.507206  hitchhiker  0.0093058 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  31.33 
 
 		 1362 aa  73.6  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0401  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.68 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0325  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.35 
 
 		 297 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1663  DNA polymerase III, epsilon subunit or related 3'-5' exonuclease  25.93 
 
 		 177 aa  70.9  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  28.89 
 
 		 1449 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  32.16 
 
 		 1390 aa  69.7  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  27.87 
 
 		 1442 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  28.33 
 
 		 1449 aa  68.2  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.32 
 
 		 565 aa  68.2  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1746  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.43 
 
 		 280 aa  67  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  27.84 
 
 		 1367 aa  65.5  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  27.84 
 
 		 1367 aa  65.5  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19710  hypothetical protein  26.37 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  25.42 
 
 		 1440 aa  63.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2432  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.77 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000167398  hitchhiker  0.000000855103 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0141  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.63 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000727822  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3538  transposase  30 
 
 		 282 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.761047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.16 
 
 		 944 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  31.98 
 
 		 578 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  26.99 
 
 		 1433 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  26.99 
 
 		 1433 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  26.99 
 
 		 1433 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  26.99 
 
 		 1433 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  26.99 
 
 		 1433 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  26.99 
 
 		 1433 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  28.74 
 
 		 1444 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.35 
 
 		 921 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  26.99 
 
 		 1433 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1294  DNA polymerase III, epsilon subunit related 3'-5' exonuclease  23.67 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.5 
 
 		 769 aa  58.9  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  26.99 
 
 		 1433 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  26.38 
 
 		 1433 aa  58.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  27 
 
 		 721 aa  58.2  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  26.38 
 
 		 1433 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.82 
 
 		 769 aa  57.4  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.09 
 
 		 930 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  26.99 
 
 		 970 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0726  DNA polymerase III subunit epsilon  30.65 
 
 		 273 aa  57  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0132  exonuclease  31.52 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0330  exonuclease  29.07 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.5 
 
 		 595 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  26.14 
 
 		 1465 aa  57  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.74 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  25 
 
 		 1432 aa  56.2  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0595  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.837923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  27.17 
 
 		 1407 aa  55.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  28.11 
 
 		 1433 aa  55.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4151  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.65 
 
 		 729 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  28.22 
 
 		 1435 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  31.11 
 
 		 584 aa  55.5  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  29.56 
 
 		 630 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  30.3 
 
 		 720 aa  54.7  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  31.32 
 
 		 645 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0238  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.52 
 
 		 731 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000829837 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1633  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.74 
 
 		 367 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.117294  hitchhiker  0.000656325 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  27.84 
 
 		 1388 aa  53.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  27.67 
 
 		 315 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.54 
 
 		 952 aa  53.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  26.06 
 
 		 1402 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  23.49 
 
 		 1365 aa  52.4  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  29.06 
 
 		 630 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  29.06 
 
 		 630 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5268  DNA polymerase III subunit epsilon  33.33 
 
 		 330 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.674728  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  27.04 
 
 		 315 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4900  DNA polymerase III subunit epsilon  33.33 
 
 		 330 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4989  DNA polymerase III subunit epsilon  33.33 
 
 		 330 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1965  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.21 
 
 		 459 aa  52.4  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249813  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.7 
 
 		 715 aa  52  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  30.21 
 
 		 1426 aa  51.6  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  27.04 
 
 		 315 aa  51.2  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  27.04 
 
 		 315 aa  51.2  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  25.76 
 
 		 315 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  24.24 
 
 		 315 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  26.26 
 
 		 1397 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>