43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4059 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  100 
 
 		 522 aa  1071    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  46.91 
 
 		 1215 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  43.95 
 
 		 1215 aa  379  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  45.45 
 
 		 1228 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  41.63 
 
 		 1163 aa  350  3e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  41.65 
 
 		 1151 aa  347  4e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  39.73 
 
 		 1350 aa  340  4e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  42.35 
 
 		 1139 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  42.83 
 
 		 1143 aa  335  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  42.83 
 
 		 1143 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  42.83 
 
 		 1143 aa  335  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  40.92 
 
 		 1196 aa  332  7.000000000000001e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  39.07 
 
 		 1250 aa  332  9e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  39.15 
 
 		 1270 aa  315  9.999999999999999e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  36.66 
 
 		 1247 aa  297  4e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  38.53 
 
 		 1153 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  38.6 
 
 		 1280 aa  241  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  36.79 
 
 		 1198 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  33.59 
 
 		 1118 aa  216  8e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  35.96 
 
 		 1082 aa  213  7e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  49.76 
 
 		 1324 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  31.24 
 
 		 1116 aa  181  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1126 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  29.78 
 
 		 1172 aa  163  7e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1121 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  29.38 
 
 		 1175 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  23.6 
 
 		 487 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24981  RecB family nuclease  25.41 
 
 		 535 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  21.77 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0719  RecB family-like nuclease  23.93 
 
 		 495 aa  69.7  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253334  hitchhiker  0.0000000430551 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  23.15 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  27.36 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  27.36 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  20.88 
 
 		 512 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03041  RecB family nuclease  23.13 
 
 		 490 aa  61.6  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0542901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  23.98 
 
 		 486 aa  57.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0229  hypothetical protein  25 
 
 		 491 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0258  hypothetical protein  22.08 
 
 		 502 aa  52.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.715645  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03101  RecB family nuclease  22.35 
 
 		 446 aa  51.6  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3303  hypothetical protein  30.17 
 
 		 222 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.844138 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  21.76 
 
 		 512 aa  50.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0518  RecB family-like nuclease  21.94 
 
 		 390 aa  47  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13317  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0524  RecB family-like nuclease  24.24 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>