More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3988 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  100 
 
 
325 aa  656    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  65.7 
 
 
318 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  64.13 
 
 
318 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  59.94 
 
 
333 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  57.54 
 
 
333 aa  374  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  59.54 
 
 
340 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  59.12 
 
 
332 aa  371  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  57.98 
 
 
353 aa  368  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  56.66 
 
 
346 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  57.23 
 
 
319 aa  361  7.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  57.05 
 
 
359 aa  361  9e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  56.95 
 
 
313 aa  354  8.999999999999999e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  55.05 
 
 
330 aa  353  2e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  57.76 
 
 
310 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  58.22 
 
 
310 aa  348  8e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  55.08 
 
 
310 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  57.89 
 
 
317 aa  343  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  55.92 
 
 
310 aa  342  4e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  55.23 
 
 
348 aa  340  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  57.14 
 
 
344 aa  336  2.9999999999999997e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  61.26 
 
 
327 aa  335  7e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  57 
 
 
330 aa  335  7.999999999999999e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  55.59 
 
 
329 aa  333  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  56.35 
 
 
331 aa  333  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  55.37 
 
 
336 aa  331  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  56.58 
 
 
309 aa  330  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  55.7 
 
 
333 aa  328  6e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  55.7 
 
 
333 aa  328  6e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  55.7 
 
 
333 aa  328  6e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  57.52 
 
 
348 aa  328  8e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  54.28 
 
 
335 aa  328  9e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  55.59 
 
 
313 aa  326  4.0000000000000003e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  54.81 
 
 
327 aa  325  5e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  55.34 
 
 
318 aa  325  6e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  54.49 
 
 
325 aa  319  3e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  55.26 
 
 
329 aa  318  5e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  53.07 
 
 
330 aa  315  6e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  52.24 
 
 
361 aa  309  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  51.13 
 
 
334 aa  305  7e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  52.79 
 
 
331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  48.84 
 
 
314 aa  301  7.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  53.99 
 
 
362 aa  300  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  53.67 
 
 
317 aa  300  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  49.51 
 
 
460 aa  297  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  46.67 
 
 
453 aa  297  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  47.94 
 
 
461 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  47.94 
 
 
461 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  49.03 
 
 
456 aa  296  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
311 aa  296  4e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  53.29 
 
 
325 aa  295  6e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  49.5 
 
 
334 aa  295  9e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0680  thioredoxin reductase  48.57 
 
 
457 aa  293  2e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  49.35 
 
 
311 aa  294  2e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  50.66 
 
 
311 aa  293  3e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  47.6 
 
 
339 aa  293  4e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12241  putative thioredoxin reductase  48.71 
 
 
463 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0425145  normal  0.220782 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  50.33 
 
 
311 aa  291  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  51.32 
 
 
332 aa  291  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  45.99 
 
 
326 aa  290  3e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15981  putative thioredoxin reductase  46.82 
 
 
458 aa  288  7e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  50.5 
 
 
321 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  49.67 
 
 
311 aa  287  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  49.02 
 
 
314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  49.02 
 
 
314 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  45.86 
 
 
327 aa  285  5.999999999999999e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  52.7 
 
 
320 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1981  thioredoxin reductase  46.33 
 
 
460 aa  285  8e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0833552 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0758  thioredoxin reductase  47.3 
 
 
458 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18111  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  48.03 
 
 
311 aa  282  5.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  49.03 
 
 
458 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  47.84 
 
 
315 aa  282  5.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  48.41 
 
 
345 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  49.01 
 
 
311 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1134  thioredoxin reductase  49.34 
 
 
313 aa  280  2e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.788555 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  47.12 
 
 
315 aa  280  3e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  47.45 
 
 
322 aa  279  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  52.15 
 
 
325 aa  279  5e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  47.95 
 
 
325 aa  278  7e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  46.95 
 
 
361 aa  278  7e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03581  Thioredoxin reductase (EC 1.8.1.9) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q08GE2]  49.22 
 
 
339 aa  277  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.813979  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  50.49 
 
 
333 aa  276  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  46.62 
 
 
321 aa  276  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0623  thioredoxin reductase  48.8 
 
 
459 aa  276  4e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66148  normal  0.453769 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28227  predicted protein  48.39 
 
 
547 aa  276  4e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0120159 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  46.95 
 
 
320 aa  276  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  47.39 
 
 
335 aa  275  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  46.62 
 
 
321 aa  275  6e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  49.34 
 
 
319 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  47.68 
 
 
316 aa  274  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1269  thioredoxin reductase  46.86 
 
 
309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  48.03 
 
 
331 aa  272  5.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1247  thioredoxin reductase  44.51 
 
 
458 aa  272  6e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  48.37 
 
 
317 aa  272  7e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  48.37 
 
 
312 aa  271  9e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  44.59 
 
 
320 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  46.41 
 
 
308 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13401  putative thioredoxin reductase  44.37 
 
 
458 aa  269  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.327116  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  47.76 
 
 
321 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  48.05 
 
 
311 aa  269  5e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13251  putative thioredoxin reductase  43.57 
 
 
458 aa  269  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>