More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3954 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011879  Achl_3954  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 
434 aa  863    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2668  preprotein translocase subunit SecY  62.84 
 
 
436 aa  564  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2956  preprotein translocase subunit SecY  63.07 
 
 
436 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226026  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16970  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  57.8 
 
 
435 aa  517  1.0000000000000001e-145  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0174147  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  55.56 
 
 
437 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  57.86 
 
 
429 aa  499  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0708  preprotein translocase, SecY subunit  55.94 
 
 
438 aa  495  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  53.78 
 
 
429 aa  489  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23600  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  54.2 
 
 
434 aa  482  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  54.23 
 
 
431 aa  479  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  56.26 
 
 
432 aa  475  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  52.16 
 
 
438 aa  477  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  54.34 
 
 
435 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  52.27 
 
 
439 aa  464  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  51.03 
 
 
430 aa  451  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3123  preprotein translocase, SecY subunit  53.17 
 
 
436 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  50.45 
 
 
441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  51.26 
 
 
430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  50.45 
 
 
441 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  51.47 
 
 
437 aa  442  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0951  preprotein translocase, SecY subunit  53.22 
 
 
448 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  52.16 
 
 
432 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  50.22 
 
 
441 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  50.22 
 
 
441 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  50 
 
 
436 aa  441  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  50.22 
 
 
441 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  50.68 
 
 
442 aa  437  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  51.36 
 
 
439 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  48.4 
 
 
436 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  50.23 
 
 
437 aa  432  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  49.44 
 
 
445 aa  428  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  48.98 
 
 
441 aa  427  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  49.44 
 
 
441 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  47.03 
 
 
435 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1053  preprotein translocase, SecY subunit  49.56 
 
 
449 aa  411  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.615544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1147  preprotein translocase, SecY subunit  46.99 
 
 
445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  48.76 
 
 
445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1206  preprotein translocase SecY subunit  45.97 
 
 
457 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533641  normal  0.0165275 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0271  preprotein translocase, SecY subunit  46.44 
 
 
447 aa  397  1e-109  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1727  preprotein translocase subunit SecY  45.52 
 
 
445 aa  389  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000416171  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  39.96 
 
 
463 aa  324  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  41.5 
 
 
423 aa  322  8e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  40.82 
 
 
435 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  41.32 
 
 
445 aa  319  7e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  42.08 
 
 
419 aa  318  9e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  43.12 
 
 
439 aa  318  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  40.18 
 
 
428 aa  318  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  41.76 
 
 
447 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  41.53 
 
 
447 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  39.23 
 
 
435 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  40.72 
 
 
427 aa  315  9.999999999999999e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  40.35 
 
 
435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  40.65 
 
 
447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  41.2 
 
 
446 aa  313  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  40.42 
 
 
448 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  42.18 
 
 
446 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  42.18 
 
 
446 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  40.91 
 
 
448 aa  313  4.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  40.74 
 
 
446 aa  312  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  39.59 
 
 
437 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  40.87 
 
 
444 aa  312  7.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  42.42 
 
 
434 aa  311  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  39.46 
 
 
435 aa  311  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  42.46 
 
 
437 aa  311  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  39.23 
 
 
435 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  41.03 
 
 
453 aa  310  4e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  41.72 
 
 
446 aa  310  4e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  39.82 
 
 
437 aa  309  5e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  41.36 
 
 
446 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000662692  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  39.68 
 
 
435 aa  308  9e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3739  preprotein translocase subunit SecY  41.36 
 
 
446 aa  308  9e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000605107  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  41.59 
 
 
446 aa  308  9e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711222  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  40.42 
 
 
437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  41.36 
 
 
446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  41.36 
 
 
424 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  38.55 
 
 
435 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  39.96 
 
 
421 aa  306  4.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  41.59 
 
 
446 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  41.59 
 
 
446 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  40.13 
 
 
419 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  38.91 
 
 
426 aa  306  5.0000000000000004e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  39.4 
 
 
443 aa  306  7e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  41.5 
 
 
419 aa  306  7e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080  preprotein translocase subunit SecY  42 
 
 
441 aa  305  9.000000000000001e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0404503  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  39.59 
 
 
449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  39.86 
 
 
429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  42.31 
 
 
421 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  40.44 
 
 
430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  40.51 
 
 
446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  41.36 
 
 
446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000744124  unclonable  0.0000000000304117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  41.36 
 
 
446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  41.36 
 
 
446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0220  preprotein translocase subunit SecY  40.91 
 
 
446 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000798254  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4036  preprotein translocase subunit SecY  40.91 
 
 
446 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  unclonable  0.00000000000435138 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4150  preprotein translocase subunit SecY  40.91 
 
 
446 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000158721  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0216  preprotein translocase subunit SecY  40.91 
 
 
446 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  41.2 
 
 
446 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  40.96 
 
 
439 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  40.96 
 
 
439 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  39.86 
 
 
443 aa  303  5.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>