More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3932 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 
216 aa  422  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4167  16S rRNA methyltransferase GidB  89.25 
 
 
228 aa  378  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  63.73 
 
 
241 aa  249  3e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  53.81 
 
 
245 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  54.31 
 
 
221 aa  200  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  51.27 
 
 
210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  52.66 
 
 
223 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  53.5 
 
 
225 aa  194  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  54.27 
 
 
254 aa  192  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  48.51 
 
 
226 aa  192  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  50.49 
 
 
250 aa  192  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  54.21 
 
 
241 aa  191  7e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  50.48 
 
 
213 aa  191  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  47.26 
 
 
236 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  51.26 
 
 
225 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  51.26 
 
 
225 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  51.01 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  49.77 
 
 
242 aa  178  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  47.18 
 
 
210 aa  178  7e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4238  methyltransferase GidB  50.5 
 
 
239 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  57.05 
 
 
237 aa  176  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  50 
 
 
227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13954  16S rRNA methyltransferase GidB  48.48 
 
 
224 aa  172  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  45.69 
 
 
210 aa  171  9e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4859  methyltransferase GidB  51.85 
 
 
205 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  46.67 
 
 
255 aa  171  1e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5106  16S rRNA methyltransferase GidB  50.69 
 
 
242 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000203893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  47.47 
 
 
212 aa  166  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  50.83 
 
 
262 aa  165  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  44.39 
 
 
242 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  47.47 
 
 
227 aa  164  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7334  16S rRNA methyltransferase GidB  46.33 
 
 
306 aa  162  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  50.25 
 
 
223 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4542  16S rRNA methyltransferase GidB  44.98 
 
 
265 aa  159  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  53.01 
 
 
222 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  43.87 
 
 
221 aa  154  8e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4863  methyltransferase GidB  52.22 
 
 
236 aa  152  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0314819  normal  0.0271689 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  45.36 
 
 
228 aa  143  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  40.14 
 
 
239 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  31.84 
 
 
238 aa  101  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  39.44 
 
 
239 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  35.98 
 
 
210 aa  98.2  8e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  38.82 
 
 
240 aa  95.9  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  35.67 
 
 
239 aa  95.9  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  38.51 
 
 
239 aa  94.4  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  35.76 
 
 
241 aa  93.2  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  32.76 
 
 
239 aa  92  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  38.31 
 
 
209 aa  92  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  39.47 
 
 
236 aa  92  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  32.76 
 
 
239 aa  92  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  35.81 
 
 
207 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  35.81 
 
 
207 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  35.81 
 
 
207 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  35.81 
 
 
207 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  36.84 
 
 
239 aa  91.3  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  37.84 
 
 
234 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  35.81 
 
 
207 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  37.91 
 
 
240 aa  90.9  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  32.69 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  32.18 
 
 
239 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  38.83 
 
 
234 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  32.18 
 
 
239 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  32.18 
 
 
239 aa  90.1  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  32.18 
 
 
239 aa  90.1  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  32.18 
 
 
239 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  32.18 
 
 
239 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  32.18 
 
 
239 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  32.78 
 
 
235 aa  90.1  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  32.18 
 
 
239 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  34.12 
 
 
238 aa  89.4  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  37.04 
 
 
239 aa  89  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  37.04 
 
 
239 aa  89  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  35.57 
 
 
206 aa  89  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  39.16 
 
 
238 aa  88.2  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  33.8 
 
 
236 aa  88.2  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  33.92 
 
 
237 aa  88.2  9e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  35.57 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  35.57 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  32.34 
 
 
239 aa  87.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3294  methyltransferase GidB  38.24 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  34.75 
 
 
240 aa  88.2  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  36.49 
 
 
253 aa  87  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3213  methyltransferase GidB  36.48 
 
 
221 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2817  methyltransferase GidB  36.48 
 
 
221 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  36.55 
 
 
240 aa  87  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  31.03 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  29.59 
 
 
231 aa  86.3  3e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  32.95 
 
 
239 aa  86.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  29.09 
 
 
212 aa  86.3  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  34.23 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  35.26 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  32.95 
 
 
256 aa  86.3  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  37.04 
 
 
212 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  33.78 
 
 
207 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  33.78 
 
 
207 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  33.78 
 
 
207 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  33.78 
 
 
207 aa  85.5  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  33.78 
 
 
207 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  33.78 
 
 
207 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  33.78 
 
 
207 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>