More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3928 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  100 
 
 
318 aa  646    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  87.74 
 
 
318 aa  580  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  67.21 
 
 
319 aa  433  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  66.23 
 
 
332 aa  430  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  64.54 
 
 
333 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  65.69 
 
 
310 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  66.01 
 
 
310 aa  424  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  64.42 
 
 
340 aa  423  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  65.13 
 
 
333 aa  422  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  61.86 
 
 
346 aa  415  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  63.19 
 
 
359 aa  417  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  63.28 
 
 
313 aa  415  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  63.69 
 
 
330 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  65.7 
 
 
325 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  61.56 
 
 
310 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  65.91 
 
 
317 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  62.3 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  65.15 
 
 
309 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  62.66 
 
 
353 aa  404  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  65.26 
 
 
344 aa  399  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  60.39 
 
 
335 aa  389  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  61.81 
 
 
310 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  59.74 
 
 
330 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  59.68 
 
 
331 aa  386  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  60.45 
 
 
333 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  60.45 
 
 
333 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  60.45 
 
 
333 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  60.65 
 
 
336 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  63.28 
 
 
348 aa  383  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  58.44 
 
 
330 aa  371  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  62.95 
 
 
327 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  56.82 
 
 
313 aa  368  1e-101  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  60.4 
 
 
325 aa  365  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  58.82 
 
 
318 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  59.42 
 
 
327 aa  367  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  59.09 
 
 
329 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  58.44 
 
 
331 aa  364  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  57.01 
 
 
361 aa  364  1e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  59.16 
 
 
329 aa  361  7.0000000000000005e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  57.45 
 
 
362 aa  354  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  58.28 
 
 
317 aa  352  4e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  53.09 
 
 
334 aa  346  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  55.23 
 
 
332 aa  341  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  49.7 
 
 
339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  57.24 
 
 
325 aa  333  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  52.3 
 
 
311 aa  328  9e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  52.43 
 
 
314 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  52.43 
 
 
314 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  53.14 
 
 
321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  55.7 
 
 
325 aa  325  7e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  51.94 
 
 
311 aa  324  1e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  51.63 
 
 
311 aa  323  2e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  53.7 
 
 
320 aa  323  2e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  49.03 
 
 
314 aa  322  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  51.49 
 
 
321 aa  321  9.000000000000001e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  51.97 
 
 
334 aa  318  7e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  51.82 
 
 
321 aa  318  7e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  50.33 
 
 
345 aa  315  5e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  52.13 
 
 
319 aa  315  5e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  51.3 
 
 
311 aa  315  6e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1269  thioredoxin reductase  51.14 
 
 
309 aa  315  6e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
311 aa  315  9e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  52.3 
 
 
321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  48.59 
 
 
361 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  49.68 
 
 
311 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  52.3 
 
 
321 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  52.63 
 
 
321 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  49.01 
 
 
311 aa  311  5.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  50.99 
 
 
317 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  50.99 
 
 
312 aa  309  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  49.02 
 
 
331 aa  308  6.999999999999999e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  50.17 
 
 
322 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  51.78 
 
 
314 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  52.4 
 
 
320 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  50.5 
 
 
320 aa  306  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  49.53 
 
 
338 aa  306  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  48.36 
 
 
314 aa  306  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  51.32 
 
 
321 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
335 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
320 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
320 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
320 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  47.45 
 
 
323 aa  303  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  49.51 
 
 
313 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  50 
 
 
346 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  50 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
312 aa  301  1e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  48.21 
 
 
325 aa  300  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  46.69 
 
 
315 aa  301  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  49.02 
 
 
324 aa  300  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  47.71 
 
 
323 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  47.71 
 
 
323 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_002620  TC0375  thioredoxin reductase  49.51 
 
 
312 aa  300  3e-80  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3442  thioredoxin reductase  49.21 
 
 
333 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  48.88 
 
 
316 aa  299  4e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  49.04 
 
 
320 aa  299  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  47.76 
 
 
325 aa  299  5e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  50 
 
 
346 aa  299  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  50.64 
 
 
458 aa  299  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  49.04 
 
 
320 aa  298  6e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.429956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>