More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3858 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3858  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 439 aa  872    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4082  major facilitator transporter  91.57 
 
 		 439 aa  805    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2329  major facilitator superfamily MFS_1  70.55 
 
 		 452 aa  592  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126091  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  54.74 
 
 		 453 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5092  major facilitator superfamily MFS_1  52.25 
 
 		 493 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  54.55 
 
 		 444 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  47.5 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3499  major facilitator transporter  45.81 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3484  major facilitator transporter  46.81 
 
 		 468 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  44.96 
 
 		 469 aa  346  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 464 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  44.84 
 
 		 461 aa  338  9e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  44.84 
 
 		 461 aa  338  9e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0634  major facilitator transporter  45.14 
 
 		 461 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0190  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  43.12 
 
 		 459 aa  336  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  42.11 
 
 		 457 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 477 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  42.33 
 
 		 457 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 457 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  42.73 
 
 		 457 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  44.96 
 
 		 468 aa  325  7e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2248  major facilitator superfamily MFS_1  45.56 
 
 		 463 aa  325  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169754  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 461 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5816  major facilitator superfamily MFS_1  42.27 
 
 		 468 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5797  major facilitator transporter  42.08 
 
 		 477 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5800  major facilitator superfamily MFS_1  43.22 
 
 		 477 aa  318  9e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000483558  normal  0.391929 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  39.04 
 
 		 450 aa  298  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  39.81 
 
 		 446 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0102  major facilitator superfamily MFS_1  40.48 
 
 		 456 aa  287  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  38.9 
 
 		 447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  38.5 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  38.5 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  38.5 
 
 		 433 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  38.26 
 
 		 433 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  38.03 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  39.75 
 
 		 441 aa  279  8e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  36.9 
 
 		 450 aa  279  8e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2371  major facilitator transporter  41.1 
 
 		 406 aa  278  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.363547  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  36.71 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  36.71 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  36.71 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 461 aa  265  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  39.26 
 
 		 432 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  39.26 
 
 		 432 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  39.26 
 
 		 432 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  34.7 
 
 		 459 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  36.94 
 
 		 456 aa  257  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  35.33 
 
 		 458 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  34.1 
 
 		 460 aa  256  6e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  41.51 
 
 		 435 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  36.71 
 
 		 447 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  34.76 
 
 		 450 aa  251  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  38.7 
 
 		 459 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  36.98 
 
 		 484 aa  249  7e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  33.17 
 
 		 430 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  38.18 
 
 		 459 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  36.67 
 
 		 440 aa  245  9e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  38.92 
 
 		 442 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 445 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  37.05 
 
 		 430 aa  242  9e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  35.17 
 
 		 445 aa  242  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  36.79 
 
 		 446 aa  242  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 445 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 445 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  35.6 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.21 
 
 		 437 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  36.95 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 460 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  35.97 
 
 		 438 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 460 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 		 437 aa  240  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  38.23 
 
 		 439 aa  239  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  35.75 
 
 		 438 aa  240  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  35.75 
 
 		 438 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  35.75 
 
 		 438 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.75 
 
 		 438 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  35.75 
 
 		 438 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  35.97 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3351  major facilitator superfamily MFS_1  35.65 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0813627  normal  0.0585989 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  35.91 
 
 		 437 aa  239  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 		 461 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 437 aa  239  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  34.83 
 
 		 460 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  35.23 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  38.12 
 
 		 443 aa  238  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  33.18 
 
 		 459 aa  239  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  34.83 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  38.29 
 
 		 438 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  36.39 
 
 		 444 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  36.39 
 
 		 444 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 444 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  36.39 
 
 		 444 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  36.39 
 
 		 444 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 445 aa  237  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  36.39 
 
 		 444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  36.39 
 
 		 444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 439 aa  236  9e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  35.56 
 
 		 524 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  37.39 
 
 		 452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>