47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3726 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3726  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 273 aa  541  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3924  ApbE-like lipoprotein  68.6 
 
 		 251 aa  311  4.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6589  ApbE family lipoprotein  36.24 
 
 		 333 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0051  ApbE family lipoprotein  32.26 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.252526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6144  ApbE family lipoprotein  34.85 
 
 		 243 aa  92.8  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.592047  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0233  ApbE-like lipoprotein  39.07 
 
 		 293 aa  85.5  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.91543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0382  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.529182  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1299  ApbE family lipoprotein  33.19 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.788342  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  34.29 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  36.99 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1244  ApbE family lipoprotein  37.59 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.75152  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  34.09 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  37.31 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0491  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  26.74 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0038  ApbE family lipoprotein  29.5 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1238  hypothetical protein  29.33 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.503143 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.13 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1128  hypothetical protein  28.96 
 
 		 284 aa  52.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110664 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1826  ApbE-like lipoprotein  31.87 
 
 		 351 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  31.82 
 
 		 371 aa  48.5  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  23.43 
 
 		 323 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  29.94 
 
 		 331 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  24.39 
 
 		 348 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  32.57 
 
 		 336 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  28.4 
 
 		 339 aa  46.6  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  25.88 
 
 		 346 aa  46.6  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.53 
 
 		 363 aa  46.2  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  24.27 
 
 		 341 aa  45.8  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  31.45 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  34.13 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  30.6 
 
 		 336 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  41.18 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 386 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  24.87 
 
 		 381 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  33.82 
 
 		 329 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  32.5 
 
 		 340 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  28.66 
 
 		 317 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  26.28 
 
 		 350 aa  43.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.7 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  41.18 
 
 		 365 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  25.75 
 
 		 339 aa  43.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  30.06 
 
 		 339 aa  42.7  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0309  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.78 
 
 		 337 aa  42.7  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.912952 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  29.51 
 
 		 349 aa  42.7  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  41.18 
 
 		 331 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  27.44 
 
 		 338 aa  42.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  27.44 
 
 		 353 aa  42.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>