28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3711 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3711  hypothetical protein  100 
 
 
654 aa  1311    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3910  hypothetical protein  69.3 
 
 
673 aa  863    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6222  hypothetical protein  42.72 
 
 
619 aa  438  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.690917  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3473  hypothetical protein  42.55 
 
 
638 aa  410  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4347  hypothetical protein  41.2 
 
 
675 aa  412  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0929  hypothetical protein  41.62 
 
 
692 aa  388  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0568347  normal  0.0205131 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02280  predicted dinucleotide-binding enzyme  41.06 
 
 
867 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2381  hypothetical protein  39.9 
 
 
584 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4373  hypothetical protein  29.86 
 
 
633 aa  296  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.32896e-21 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3018  hypothetical protein  33.28 
 
 
603 aa  277  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0249937  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1050  hypothetical protein  31.75 
 
 
618 aa  262  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526264  normal  0.107352 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0676  hypothetical protein  33.38 
 
 
659 aa  244  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758616  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0823  hypothetical protein  30.08 
 
 
651 aa  216  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03600  hypothetical protein  31.87 
 
 
651 aa  212  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4655  hypothetical protein  37.32 
 
 
770 aa  207  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134449  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17770  hypothetical protein  29.65 
 
 
644 aa  201  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413089  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2071  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  26.84 
 
 
616 aa  188  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1458  putative lipoprotein  27.72 
 
 
624 aa  176  9e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11200  hypothetical protein  29.08 
 
 
593 aa  171  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1859  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  24.01 
 
 
623 aa  169  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41800  hypothetical protein  25.67 
 
 
615 aa  134  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2744  hypothetical protein  27.59 
 
 
580 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0706789  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1163  hypothetical protein  27.93 
 
 
742 aa  107  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0617  hypothetical protein  24.49 
 
 
624 aa  100  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108776  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2959  hypothetical protein  24.55 
 
 
551 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0119375  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1205  hypothetical protein  24.95 
 
 
593 aa  92  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721959  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11418  hypothetical protein  20.78 
 
 
580 aa  82.8  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  29.82 
 
 
474 aa  48.1  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>