More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3685 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  401  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  28.65 
 
 		 510 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  25.54 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1139  TetR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  48.39 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  43.01 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  34.06 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  22.84 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3451  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6862  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000147849  normal  0.19991 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3099  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296713  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 285 aa  52  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  52  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2089  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 184 aa  51.6  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.850407  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 225 aa  51.6  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 231 aa  51.6  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 477 aa  51.2  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 477 aa  51.2  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  22.49 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  22.49 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 318 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 316 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 318 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 317 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 272 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 276 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 316 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 318 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 318 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 316 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  21.89 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 273 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 240 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 272 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  21.89 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  21.89 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 273 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  23.03 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 277 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  22.78 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 273 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0161  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 221 aa  48.9  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 273 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  43.24 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>