More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3596 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_13350  serine hydroxymethyltransferase  78.72 
 
 
423 aa  660    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3596  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
447 aa  902    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0535  Glycine hydroxymethyltransferase  77.23 
 
 
434 aa  655    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3847  Glycine hydroxymethyltransferase  75.23 
 
 
420 aa  644    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2884  Glycine hydroxymethyltransferase  78.4 
 
 
442 aa  654    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0767  serine hydroxymethyltransferase  75.88 
 
 
445 aa  660    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3705  serine hydroxymethyltransferase  84.55 
 
 
453 aa  743    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2353  serine hydroxymethyltransferase  76.47 
 
 
423 aa  632  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0383526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0424  Glycine hydroxymethyltransferase  74.65 
 
 
422 aa  622  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3186  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1189  serine hydroxymethyltransferase  74 
 
 
432 aa  619  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000045975 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1663  Glycine hydroxymethyltransferase  70.16 
 
 
435 aa  616  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0657  Glycine hydroxymethyltransferase  75.53 
 
 
452 aa  612  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10070  serine hydroxymethyltransferase  71.66 
 
 
425 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.9411  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1115  serine hydroxymethyltransferase  72.81 
 
 
435 aa  613  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234213  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18800  serine hydroxymethyltransferase  75 
 
 
412 aa  610  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2501  Glycine hydroxymethyltransferase  69.53 
 
 
427 aa  601  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0694  serine hydroxymethyltransferase  69.72 
 
 
429 aa  599  1e-170  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27940  serine hydroxymethyltransferase  70.66 
 
 
430 aa  600  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.958283  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3130  Glycine hydroxymethyltransferase  71.29 
 
 
432 aa  597  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11114  serine hydroxymethyltransferase  69.63 
 
 
426 aa  595  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000666035  normal  0.472146 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4629  Glycine hydroxymethyltransferase  70.56 
 
 
430 aa  595  1e-169  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0754  Glycine hydroxymethyltransferase  69.79 
 
 
428 aa  592  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128225  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04680  serine hydroxymethyltransferase  69.78 
 
 
426 aa  592  1e-168  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5659  Glycine hydroxymethyltransferase  75.06 
 
 
421 aa  578  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3981  Glycine hydroxymethyltransferase  72.49 
 
 
434 aa  571  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.638114 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21370  serine hydroxymethyltransferase  68.22 
 
 
422 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.100651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2989  Glycine hydroxymethyltransferase  69.86 
 
 
440 aa  566  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  66.35 
 
 
474 aa  553  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  61.87 
 
 
415 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  61.43 
 
 
417 aa  512  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  60.38 
 
 
415 aa  508  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 
415 aa  510  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  59.67 
 
 
415 aa  508  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 
413 aa  510  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  59.23 
 
 
412 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  59.14 
 
 
418 aa  502  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  60.94 
 
 
431 aa  504  1e-141  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 
415 aa  504  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 
413 aa  498  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  59.23 
 
 
415 aa  501  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  59.23 
 
 
415 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  59.67 
 
 
415 aa  496  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  56.94 
 
 
412 aa  498  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  57.18 
 
 
416 aa  496  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  60.48 
 
 
417 aa  497  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  58.95 
 
 
438 aa  496  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  59.52 
 
 
412 aa  494  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  58.81 
 
 
413 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  59.25 
 
 
429 aa  494  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  59.42 
 
 
412 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  58.06 
 
 
417 aa  492  9.999999999999999e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 
417 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  59.42 
 
 
412 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  59.05 
 
 
413 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  58.22 
 
 
417 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  60.48 
 
 
417 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  57.78 
 
 
439 aa  489  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  58.57 
 
 
413 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  58.57 
 
 
414 aa  489  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  58.81 
 
 
414 aa  491  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 
417 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  58.1 
 
 
416 aa  491  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 
417 aa  490  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  58.96 
 
 
431 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  58.81 
 
 
413 aa  488  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  56 
 
 
415 aa  490  1e-137  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  58.16 
 
 
437 aa  490  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  58.57 
 
 
413 aa  491  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  58.33 
 
 
413 aa  489  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  57.51 
 
 
415 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  58.33 
 
 
414 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  57.51 
 
 
415 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  57.65 
 
 
415 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0603  serine hydroxymethyltransferase  57.62 
 
 
416 aa  486  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2449  serine hydroxymethyltransferase  57.75 
 
 
415 aa  487  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1438  glycine hydroxymethyltransferase  58.77 
 
 
421 aa  486  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  57.51 
 
 
415 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  57.51 
 
 
415 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  59.38 
 
 
417 aa  488  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  58.33 
 
 
413 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  56.43 
 
 
413 aa  485  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  57.41 
 
 
415 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  56.94 
 
 
415 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  58.27 
 
 
417 aa  484  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  57.51 
 
 
415 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  57.78 
 
 
434 aa  485  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  57.98 
 
 
417 aa  488  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  57.51 
 
 
415 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  57.51 
 
 
415 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  57.65 
 
 
415 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  57.65 
 
 
415 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  59.57 
 
 
431 aa  487  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  58.91 
 
 
417 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  58.91 
 
 
417 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  58.06 
 
 
433 aa  481  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  58.22 
 
 
431 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  58.03 
 
 
417 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  58.49 
 
 
427 aa  483  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3363  serine hydroxymethyltransferase  57.98 
 
 
415 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  58.67 
 
 
417 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>