More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3568 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
315 aa  642    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.44 
 
 
300 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.38 
 
 
290 aa  422  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  60.51 
 
 
275 aa  363  2e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.04 
 
 
278 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.482027  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.68 
 
 
278 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.716321  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7346  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  53.85 
 
 
278 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.01 
 
 
276 aa  335  9e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.33 
 
 
301 aa  252  6e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.98 
 
 
299 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050805  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
273 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2544  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.09 
 
 
299 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.92 
 
 
299 aa  230  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.58 
 
 
284 aa  229  5e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.29 
 
 
292 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.660216  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.32 
 
 
281 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00417189  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.86 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227991  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.04 
 
 
285 aa  218  7e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.65 
 
 
292 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.95 
 
 
301 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00963253  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.88 
 
 
276 aa  217  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0775264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  39.05 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.19 
 
 
324 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.051903  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  38.32 
 
 
277 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.96 
 
 
279 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.07 
 
 
299 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0352539  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.83 
 
 
279 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000188602  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.72 
 
 
291 aa  210  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
300 aa  209  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17142  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.77 
 
 
307 aa  207  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
298 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
290 aa  207  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
275 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  39.5 
 
 
277 aa  206  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
318 aa  206  5e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000451963  hitchhiker  0.00127985 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
272 aa  206  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 
279 aa  205  8e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
281 aa  205  9e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
271 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.31 
 
 
275 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
305 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00998336  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3392  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40.08 
 
 
278 aa  203  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196448  normal  0.954202 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  37.5 
 
 
281 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
291 aa  203  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.276199 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  36.82 
 
 
276 aa  202  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 
296 aa  202  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000371485  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40 
 
 
302 aa  202  7e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  38.65 
 
 
271 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
271 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  39.6 
 
 
278 aa  202  9e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  36.86 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  37.5 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
274 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  40.7 
 
 
295 aa  200  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  37.04 
 
 
269 aa  200  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
301 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 
294 aa  199  7e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
280 aa  199  7e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
295 aa  198  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
296 aa  198  9e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0903437  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
280 aa  196  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.697078  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.24 
 
 
324 aa  196  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.58 
 
 
300 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
302 aa  196  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.07 
 
 
297 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
311 aa  195  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
308 aa  194  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
275 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
280 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  35.66 
 
 
278 aa  194  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.7 
 
 
268 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
279 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.67338  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.86 
 
 
310 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  37.36 
 
 
286 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  32.67 
 
 
306 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 
273 aa  192  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.256296  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.95 
 
 
298 aa  192  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
303 aa  192  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  38.57 
 
 
290 aa  192  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 
302 aa  192  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  36 
 
 
272 aa  192  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
272 aa  192  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29340  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.05 
 
 
280 aa  192  8e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
294 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.41 
 
 
286 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.143013 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
280 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5582  ABC transporter membrane spanning protein (galacturonic acid)  36.24 
 
 
293 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12076  sugar ABC transporter membrane protein  36.86 
 
 
280 aa  189  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  36.26 
 
 
275 aa  189  7e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
280 aa  188  8e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2532  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.82 
 
 
275 aa  188  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.73 
 
 
271 aa  188  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 
306 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1703  putative transport system permease ABC transporter protein  38.46 
 
 
292 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.757038  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
305 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1550  MalG-type ABC sugar transport system permease component  33.77 
 
 
308 aa  187  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
275 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>